Lib.rs

› 关键词 #生物信息学 #解析器 #数字 #DNA #FASTA #k-mer #转义 #随机

#sequence

  1. anes

    ANSI转义序列提供程序和解析器

    v0.2.0 2.4M #ansi-term #ansi #sequence #parser #terminal #ansi-codes #code

  2. louds-rs

    高性能的LOUDS（按层次顺序单度序列）库

    v0.7.0 35K #louds #succinct #degree #sequence #performance #high #level-order

  3. vob

    具有Vec类似API和usize后端存储的位向量

    v3.0.3 13K #bits #usize #performance #api #vec #backing #sequence

  4. bio-seq

    位打包和类型安全的生物序列

    v0.13.0 #k-mer #dna #sequence #bioinformatics #genomics #kmer #data-encoding

  5. difflib

    将Python的difflib库移植到Rust

    v0.4.0 2.0M #diff #text #python #port #comparing #sequence #unified-diff

  6. ufotofu

    用于延迟消费和生成序列的抽象

    v0.4.2 950 #error #sequence #consuming #abstraction #producing #stream #processing

  7. bevy-sequential-actions

    Bevy库，用于按顺序执行各种操作

    v0.11.0 1.1K #action #bevy #sequence #command #gamedev

  8. hgvs

    将biocommons/hgvs移植到Rust

    v0.17.2 600 #sequence #cache #port #genome #genetic #database-access #seqrepo

  9. verify-same-kmer-content

    验证SPSS是否与一组unitigs具有相同的kmer内容

    v1.3.1 #k-mer #set #content #verify #genomic #sequence #fasta

  10. framels

    用于以友好方式列出框序列的命令行工具

    v0.7.6 110 #exr #frame #command-line-tool #sequence #list #animation #vfx

  11. vtparse

    低级转义序列解析器

    v0.6.2 51K #escaping #ansi-term #sequence #parser #ansi #terminal #escape-sequences

  12. escape-artist

    终端转义序列的可视化工具

    v0.6.7 650 #escaping #ansi-codes #terminal #command-line-interface #sequence #shell #applications

  13. newline-converter

    换行字节转换库

    v0.3.0 201K #newlines #line-break #conversion #convert #sequence #line-breaks

  14. fasta-stats

    FASTA（生物序列）数据的描述性统计

    v0.3.1 #fasta #statistics #sequence #biological #data #compute #descriptive

  15. fastqc-rs

    用rust编写的FASTQ文件快速质量控制工具

    v0.3.4 190 #fastq #quality #control #statistics #tool #sequence #results

  16. mtree2

    遍历mtree记录文件的条目

    v0.6.5 550 #file #checksum #record #entries #mtree #iterating #sequence

  17. osclip

    从终端复制文本到系统剪贴板的小工具

    v0.1.1 #clipboard #terminal-text #ansi #sequence #stdin #ssh #serial

  18. seqdupes

    压缩序列重复项

    v0.2.0 #fasta #fastq #duplicates #sequence #remove #compression #deduplicate

  19. knock-cli

    端口敲击客户端

    v0.1.0 #port-knocking #sequence #firewall #ssh #connection #attempt #knock

  20. cseq_benchmark

    用于基准测试紧凑序列和位图的程序

    v0.1.1 #bit-vector #benchmark #succinct #sequence #compression #elias-fano #data-structures

  21. noodles-bam

    二进制比对/映射（BAM）格式读取器和写入器

    v0.66.0 3.8K #bam-format #bioinformatics #file-format #reader-writer #sam #io #sequence

  22. fakit

    fasta文件操作程序

    v0.3.8 150 #fasta #sequence #file-format #bio #fa #compression-level

  23. noodles-fasta

    FASTA格式读写器

    v0.42.0 5.3K #fasta #sequence #text-format #file-format #file-io #writer #bioinformatics

  24. rand-unique

    一个用于生成唯一整数随机序列的O(1)时间crate

    v0.2.2 1.2K #sequence #numbers #random #unique #integer #prime #random-seed

  25. biotest

    为生物信息学生成随机测试数据

    v0.2.0 160 #random #test #bioinformatics #data #sequence #vcf #fastq

  26. tscale_sequence

    生成tscale序列

    v0.1.2 310 #sequence #math #gamedev #population #rate #age #group

  27. rand-sequence

    一个用于生成唯一整数随机序列的O(1)时间crate

    v0.2.1 #random #numbers #sequence #unique #prime #random-seed

  28. noodles-fastq

    FASTQ格式读写器

    v0.14.0 4.5K #fastq #sequence #writer #quality #bioinformatics #read #format

  29. fnrs

    我喜欢的一些有用的函数

    v0.1.8 #functional #sequence #fancy

  30. nucleob

    生物信息学：碱基和氨基酸统计

    v1.1.1 #bioinformatics #genetic #dna #rna #protein #statistical-analysis #sequence

  31. seqgen

    序列生成库

    v0.3.3 210 #sequence #iterator #generation #lazy-evaluation #generate #elements #generated

  32. dicom-parser

    DICOM数据集的中级解析器和打印器

    v0.7.1 3.6K #dicom #parser #data-set #medical-imaging #printing #sequence #tokens

  33. incr

    用于检查新值是否大于前一个最大值的快速且自包含的数据结构

    v0.2.1 #timestamp #sequence #atomic #increment #event-loop #data-structures

  34. kronos

    计算复杂的时间表达式

    v0.1.5 230 #date-time #date #sequence #time #calendar #chrono

  35. base_sequence_compression

    压缩和解压缩DNA序列

    v0.1.2 130 #dna #sequence #compressing #storage #base #bits #decompressing

  36. lds-rs

    Rust中的低偏差序列生成

    v0.1.2 #sequence #low #discrepancy #generation

  37. twobit

    TwoBit序列文件格式的纯Rust实现

    v0.2.1 #file-format #sequence #genome #2bit #gene #file-reader

  38. digit-sequence

    u8数字序列

    v0.3.5 #sequence #digits #conversion #serde-json #integer

  39. knockd

    用Rust编写的端口敲击服务器

    v0.1.0 #port-knocking #sequence #firewall #connection #ssh #attempt #rules

  40. combin-iterator

    用于组合迭代器的某些实用功能

    v0.2.2 #iterator #iteration #tool #sequencial #sequence

  41. sequence_domain

    DNA/RNA序列域

    v0.2.0 260 #sequence #domain #rna #dna #dna-rna #abstracting

  42. seqkmer

    序列kmer

    v0.1.0 140 #k-mer #sequence #bioinformatics #dna #genomics

  43. dominoes_oma

    使用优化方法和算法(OMA)生成多米诺骨牌序列和谜题

    v0.2.1 360 #puzzle #oma #algorithm #sequence #optimization #methods #generation

  44. cseq

    紧凑序列

    v0.1.2 #compression #sequence #data-structures #succinct #elias-fano #wavelet-matrix

  45. traitsequence

    抽象序列的特质

    v2.0.0 330 #sequence #traits #abstract #strong-typedef #data-structures

  46. kmerHLL

    kmer计数，hyperloglog，概率计数

    v0.1.0 #kmerhll #k-mer #hyper-log-log #sequence #min-hash #probabilistic #fasta #counting

  47. oxt-confidence

    计算与一定数量序列距离的数的置信度

    v0.2.5 #confidence #sequence #numbers #calculate #amount #away

  48. nthash

    用于在DNA序列中哈希所有可能的k-mer的滚动哈希函数

    v0.5.1 #bioinformatics #hash #rolling #hashing #sequence #genomics #k-mer

  49. kodiak-sets

    管理支持独特功能的通用集合

    v0.2.0 #sequence #set #generic #set-operations

  50. comma_serde_urlencoded

    支持逗号分隔格式序列和元组的序列化与反序列化的serde_urlencoded

    v0.8.1 310 #tuple #comma #urlencoded #sequence #serde

  51. phargs

    Rust中的序列处理

    v0.1.1 #command #sequence #processing #command-runner

  52. quasirandom

    数字生成

    v0.3.0 #random #sequence #discrepancy #low-discrepancy

  53. laminar-bcs

    二进制规范序列化（BCS）

    v0.1.3 #deserialization #binary-representation #binary-encoding #bcs #canonical #length #sequence

  54. gb-io

    解析、写入和操作Genbank序列文件

    v0.7.1 700 #sequence #gb #genbank #manipulating #annotations #reading #features

  55. byte_stream_splitter

    通过分隔序列分割字节数据流

    v0.2.0 #byte-stream #byte-sequences #byte #stream #sequence #split

  56. idable

    一些无锁的序列

    v0.1.2 #id #lock #sequence #generate #testing #repetition

  57. orchestrator

    编排序列

    v0.2.2 #orchestration #sequences #pipeline #data-processing #sequence

  58. conseq

    条件重复序列中的一段代码的宏

    v0.1.0 #macro #repeat #conditionally #piece #counter #sequence #sequential

  59. strseq

    Rust 的字符串序列库

    v0.1.1 #string #string-representation #buffer #sequence #compact #immutability #spans

  60. nxml

    NXML（NXML 不是 XML！）的解析器

    v3.0.0 #xml-parser #markup-language #text-node #syntax #sequence #escaping #brackets

  61. fibext

    Rust 的高效斐波那契数列生成器，支持大数和可选迭代器接口

    v0.2.1 #fibonacci-sequence #fibonacci-number #fibonacci #numbers #sequence #math #science

  62. letter-sequence

    创建显示为大写或小写字母或数字的序列的方法

    v2.1.0 #sequence #upper-case #lower-case #letter #output #digits #rendered

  63. smooth-numbers

    生成平滑数的算法

    v0.4.2 #sequence #3-smooth #pratt #a003586 #hamming-numbers

  64. pascii

    图像 => 文本

    v0.1.0 #text-image #ansi #escaping #characters #sequence #jp2a #ripoff

  65. lipmaa-link

    计算 lipmaa 序列号的函数

    v0.2.2 130 #numbers #sequence #lipmaa #link #calculate #bamboo #length

  66. sea-canal

    识别整数序列中的模式

    v0.3.0 #pattern #sequence #analysis #analyzer #analyze #math

  67. granular-id

    任意精度的 ID 号

    v0.4.2 #id #numbers #precision #component #granular-id-t #ordered #sequence

  68. adrnaln

    具有管理数据序列的高级构造的 UDP 数据包传输

    v0.1.2 #sequence #high-level #udp #packet #constructs #transfer #data

  69. syntaxdot

    神经序列标注器

    v0.5.0 #neural #sequence #lemmatization #parser #bert #labeler #labeling

  70. port-knocking-doors

    端口敲击。它与 Linux 服务器上的 firewalld 一起工作。

    v1.1.2 #port-knocking #binary #udp #sequence #server-port #daemon #file

  71. samcomp

    序列比对/映射文件的比较工具

    v0.1.3 #sequence #comparison #bioinformatics #tool #alignment-map #reads #line

  72. sequencefile

    原生Rust库，用于处理Hadoop序列文件。目前仅支持读取。

    v0.2.0 #hadoop #decoding #sequence #reading #handles #reader #prototype

  73. achoo

    缩写选择器

    v1.0.1 #acronym #letter #wildcard #phrases #words #sequence #name

  74. gc-sequence

    用于编码在gc-arena上运行的计算的安全点的系统

    v0.2.2 #garbage-collection #sequence #safe #gc-arena #points #computation #step

  75. simple_env_load

    无依赖项的.env加载器

    v0.2.0 100 #env-file #loader #sequence #parse #comments #line #blank

  76. rust-distributed-id

    Rust版本的Twitter雪花算法

    v0.1.3 #distributed-id #snowflake #id-generator #worker #bits #node #sequence

  77. specs-task

    SPECS ECS的Fork-join多任务处理

    v0.4.0 #specs #ecs #task #multitasking #fork-join #entities #sequence

  78. longest-increasing-subsequence

    寻找某个输入序列的最长递增子序列

    v0.1.0 15K #increasing #longest #subsequence #sequence #find #lis #input

  79. fqgrep

    在给定的ref或alt序列中搜索匹配的fastq文件中的reads

    v1.0.2 #fastq #bioinformatics #match #reads #sequence #pair #ref

  80. sequencetree

    一种新的数据结构，用于存储键及其对应的值

    v0.1.4 #key-value #collection #store-key #tree #sequence #amount #collections

  81. proof-of-history

    Proof of History的简单、极简的演示实现

    v0.1.0 #hashing #tick #sequence #proof #hash #history #algorithm

  82. xiv-emote-parser

    将FFXIV的emotes日志消息解析成消息部分序列

    v0.1.8 #log-messages #log-parser #message #text #api #dynamic #sequence

  83. ratman-netmod

    Ratman网络驱动程序的接口和帧抽象

    v0.5.1 #frame #networking #drivers #abstraction #ratman #netmod #sequence

  84. is_utf8

    判断字节序列是否为有效UTF-8的功能

    v0.1.4 #utf-8 #byte #valid #sequence #determine #avx #sse

  85. genome

    用于生成GAN生成器DNA的包

    v0.3.0 #dna #random #sequence #generate #generator #gan #create

  86. frame-sequence

    将帧序列字符串转换为帧号列表

    v0.1.1 #frame #sequence #graphics #parser #rendering #list #frames

  87. pkts

    构建、检查和修改网络协议数据包的工具

    v0.1.3 #layer #packet #protocols #transport-layer #network #sequence #ipv4

  88. halton

    生成Halton序列的模块

    v0.2.1 #sequence #deterministic #low #random #generate #distribution #uniform

  89. syntaxdot-transformers

    如BERT之类的Transformer架构

    v0.5.0 #transformer #architecture #sequence #models #bert #labeling #parser

  90. sqnc

    序列的特性和适配器

    v1.0.0 #sequence #traits #adaptors #no-std #iterator #range #usize

  91. edit_tree

    在rust中编辑树

    v0.2.1 #sequence #alignment #lemmatization #transduction

  92. seq_watcher

    用于监控一个或多个序列数据流的成对结构

    v0.1.1 #data-stream #sequence #monitoring #multiple #structures #pair #monitors

  93. serde-mobile

    为serde反序列化器提供面向移动的序列和映射访问类型

    v3.0.0 #map #sequence #deserializer #move-oriented #adapter #access #traits

  94. biogarden

    一组基本的生物信息学算法

    v0.1.0 #sequence #bioinformatics #sequence-alignment #algorithm #ds #seq #pattern

  95. seqname

    按顺序命名目录中的文件

    v0.2.1 #directory #rename #sequence #prefix #sequentially #numbers #suffix

  96. syntaxdot-encoders

    语言特征编码器

    v0.5.0 #encoder #linguistic #sequence #labeling #parser #label #lemmatization

  97. dialogi

    对话解析器

    v0.1.0 #dialog #text #markdown-text #parser #sequence #sequential #header

  98. seqknock-common

    基于TCP序列号的敲击；通用来源

    v0.1.0 #sequence #numbers #firewall #knocking #tcp #source #rules

  99. choreographer

    用于RGB LED组的颜色模式序列器

    v0.0.4 #rgb-led #group #pattern #intended #sequence #timer #action

  100. split-tk

    分割数据

    v0.1.0 #tool #split #data #tags #sequence #command #helper

  101. rusty-snowflake

    生成和解析Snowflake ID

    v0.2.0 200 #snowflake-id #id-generator #generate #parser #worker #timestamp #sequence

  102. cattocol

    将两个文本作为列合并为一个文本

    v0.3.1 #text #column #concat #format #sequence #combine-text

  103. sully_peg

    用于PEG生成的Proc宏

    v0.1.11 #peg #spans #range #zero #generation #atomic #sequence

  104. seq2xypic

    将文本序列图转换为LaTeX xypic图

    v0.1.1 #diagram #latex #sequence #text #description #io #turn

  105. file-seq

    使用文件系统作为存储的容错文件序列

    v0.2.0 #sequence #file-sequence #seq #store #fail-safe #increment #system

  106. translating-symbolic

    一个程序，用于将来自两个分支的圆图上的符号序列翻译成第一次重复的圆图。参阅README。

    v0.1.2 #map #circle #sequence #translation #branch #translating #cycle

  107. ngrams

    从序列生成n-gram

    v1.0.1 1.5K #generate #sequence #ngrams #vec

  108. samfilt

    序列比对/映射文件过滤工具

    v0.1.0 #filtering #sequence #tool #alignment-map

  109. 类似斐波那契

    一个小型crate，用于与无_std支持的二阶序列（如斐波那契序列）交互

    v0.1.3 #fibonacci-sequence #order #second #sequence #fibonacci #no-std

  110. syntaxdot-cli

    神经序列标注器

    v0.5.0 #sequence #neural #parser #lemmatization #bert #pretrained-models #labeler

  111. sdust

    对称DUST算法，可选CLI

    v0.1.0 #dna #sequence #bio #region

  112. lds-color

    Rust中的低差异序列颜色生成

    v0.1.0 #color #low #generation #sequence #discrepancy

  113. sphere-n-rs

    Rust中的N-Sphere代码生成

    v0.1.0 #generation #sequence #low #n-sphere #s-n #discrepancy

  114. ctw

    CTW序列预测器

    v0.1.0 #sequence #prediction #context #tree #algorithm #weighting

  115. rust-parallelfastx

    并行迭代FASTA/FASTQ文件，当序列顺序不重要但速度重要时使用

    v0.1.1 #bioinformatics #parallel #sequence #fasta-fastq #matter #speed #order

  116. hipparchus-az

    角度表示、转换和计算

    v0.1.2 #moving-average #mean #sequence #lpnorm

  117. avamain

    根据生成的字符序列检查域名可用性

    v0.1.0 #domain #availability #tld #character #length #sequence #generated

  118. best

    获取与关联值相关的序列的最佳值

    v0.13.0 #sequence #value #associated

    119. 尝试使用DuckDuckGo搜索 搜索.

  119. v-trie

    只是一个通用的压缩前缀树

    v0.1.2 #prefix-tree #compression #vector #sequence #generic #string #comparison

  120. colorseq

    管理VT颜色序列

    v1.0.0 #color #sequence #console #graphics #vt #colors

  121. gbparser

    提供GenBank序列记录文件的表示，实现Iterator的读取器

    v0.1.0 #sequence #representation #records #memory #parser #gen-bank #reader

  122. syntaxdot-tokenizers

    子词分词器

    v0.5.0 #tokenize #subword #lemmatization #syntax #bert #sequence #labeling

  123. random_tester

    类似于 https://www.fourmilab.ch/random/

    v0.1.0 #numbers #sequence #testing #stream #byte #fourmilab #ch-random

  124. vlseqid

    非常长的序列ID

    v0.4.0 #long #identifier #sequential #id #sequence

  125. weyl

    Rust的Middle Square Weyl序列RNG

    v0.1.3 #rng #sequence #middle #square #generator #numbers

  126. rust-gc-count

    GC和序列工具

    v0.1.0 #fasta #gc #bio #sequence #wiggle #dna #command-line

  127. kolakoski

    序列迭代器

    v2.0.0 #sequence #iterator #numbers #oeis #testing #information #found

  128. nys_fib

    计算斐波那契序列

    v0.1.0 #fibonacci-sequence #fibonacci #sequence #calculating

  129. syncmers

    寻找syncmers

    v0.1.5 #sequence #fasta #fastq #bioinformatics

  130. fil_ls

    用于以友好方式列出框序列的命令行工具

    v0.1.3 #command #sequence #frame #line #friendly #list #command-line-tool

  131. rust-seq2kminmers

    从DNA序列构建和迭代k-min-mers

    v0.1.0 #bioinformatics #sequence #iteration #dna #iterator #position #space

  132. collatz_length

    计算给定数字的Collatz序列长度

    v0.1.1 #numbers #length #sequence #calculate #collatz

  133. legion-task

    Legion ECS的Fork-join多任务

    v0.1.0 #task #ecs #legion #task-runner #fork-join #multitasking #sequence

  134. prepare_fasta

    计算序列的基于哈希的签名，并执行预处理

    v0.1.0 #生物信息学 #科学 #签名 #计算 #序列 #执行 #预处理

  135. iodyn

    使用Adapton的增量集合库

    v0.2.1 #增量 #序列 #记忆化 #adapton #raz #共享数据 #数据结构

  136. esc-seq

    打印简单的转义序列

    v0.1.2 #转义 #序列 #seq

  137. fakerng

    伪造RngCore

    v0.1.0 #伪造 #重复 #rng-core #序列 #单个 #重复-seq-fake-rng #调试

  138. sbr

    推荐模型

    v0.4.0 #用户 #推荐 #序列 #模型 #物品 #数据集 #机器学习

  139. lukkid

    算术序列

    v0.1.0 #序列 #数学 #序列

  140. hipparchus-seq

    生成数学中定义的各种序列

    v0.1.2 #斐波那契序列 #序列 #斐波那契 #卡特兰 #帕多瓦 #lookandsay

  141. cascade-error

    错误级联：更多关于错误的信息

    v0.1.2 #错误 #错误消息 #信息 #位置 #序列 #调用 #原始

  142. mutual_strip

    从两侧去除字符串

    v0.1.1 #去除 #字符串 #侧面 #strippig #序列 #特性

  143. hwatch-ansi-parser

    使用nom解析ANSI转义码

    v0.9.0 #ansi #解析器 #转义 #序列 #迭代器 #实现 #枚举

  144. immutable-seq

    不可变序列数据结构

    v0.1.2 #不可变性 #序列 #数据结构 #集合

  145. seqknock-proxycmd

    基于TCP序列号的敲击；OpenSSH风格的proxycmd实现

    v0.2.0 #序列 #tcp #主机名 #seqknock #端口 #ipv4 #连接

  146. blastdb-sequence-util

    在BLAST数据库格式中编码核苷酸/蛋白质序列

    v0.1.0 #blast #生物信息学 #格式 #序列 #数据库 #转换 #编码

  147. curses-game-wrapper

    为curses游戏提供包装以制作游戏AI

    v0.0.4 #游戏-ai #人工智能 #curses #子进程 #控制 #序列 #vte

  148. serde-mappable-seq

    非官方的第三方 serde（反）序列化器，用于可映射序列

    v0.1.0 #sequence #user #serialization #deserialize #third-party #hash-map #serde

  149. 语法点摘要

    TensorBoard 摘要写入器

    v0.5.0 #summary #writer #parser #tensor-board #sequence #write #pretrained-models

  150. isoperm

    约束排列

    v0.1.2 #variables #constraints #permutation #constrained #sequence #value #unknown

  151. sequence_buffer

    序列缓冲区数据结构实现

    v0.1.0 #sequence #buffer #data #structure #data-structures #numbers #constant-time

  152. byte-sequence

    创建用于作为字节序列（例如 ApiKeys，SessionIds 等）的结构体的宏

    v0.2.2 #byte-sequences #api-key #create #sequence #structs #session-ids #marco

  153. split_by

    通过多个字节序列分割实现 Read 特性的任何内容

    v0.2.2 #split #multiple #sequence #iterator

  154. seqset

    基于字符集的高效迭代器序列

    v0.1.1 #charset #sequence #iterator #language

  155. ukhasnet-parser

    UKHASnet 协议的解析器

    v0.4.0 #parser #protocols #ukha-snet #ukhasnet #packet #sequence #comment

  156. timewrap

    虚拟时间线的异步糖

    v0.3.4 #virtual #async #async-task #timeline #sequence #execution #time

  157. randseqsum

    查找随机整数序列，该序列的总和为某个值的库+二进制crate

    v0.1.0 #sequence #up #random #value #integer #sums #generates-random

  158. seqknock-nftables

    基于 TCP 序列号的敲击；基于 nftables 的服务器保护器

    v0.2.0 #nftables #sequence #firewall #numbers #tcp-server #knocking #debugging

  159. li-stephens

    Li+Stephens 模型，用于根据参考等位基因集预测给定测试序列的可能性

    v0.1.0 #dna #biology #genetic #sequence #model #reference #stephens

  160. fiblib

    非常简单的斐波那契数列生成器 - 返回大小为n的向量

    v0.1.0 #nth #sequence #fibonacci #size #generator #vector #fibonacci-sequence

  161. recaman

    Recaman序列迭代器

    v0.1.0 #sequence #iterator #a005132

  162. stackpng

    一个用于从PNG序列创建类似Minecraft动画的命令行工具

    v0.1.1 #minecraft #animation #png #sequence #cli-tool #image #minecraft-style