##dna

  1. blutils-cli

    blutils库的CLI端口

    v8.2.0 1.5K #blast #生物信息学 #dna #ncbi #相似度分析 #一致性算法
  2. d4-framefile

    D4文件格式的Framefile容器crate

    v0.3.9 180 #d4 #文件格式 #深度 #测序 #容器 #读取 #dna
  3. bio-seq

    位打包且类型良好的生物序列

    v0.13.0 #k-mer #dna #序列 #生物信息学 #基因组学 #kmer #数据编码
  4. classeq-watcher

    Classeq项目的监视器

    v0.10.0 1.6K #生物信息学 #dna #定位 #系统发育
  5. classeq-cli

    Classeq库的命令行界面

    v0.10.0 1.4K #定位 #dna #生物信息学 #系统发育
  6. classeq-api

    Classeq的API

    v0.10.0 1.4K #生物信息学 #定位 #dna #系统发育
  7. coverm

    宏基因组读覆盖率的计算器

    v0.7.0 #覆盖 #读取 #宏基因组 #bam #计算器 #基因组 #dna
  8. umgap

    Unipept宏基因组分析管道

    v1.1.0 #宏基因组 #dna #unipept #生物 #索引文件 #转录组学 #样本
  9. fxread

    rust的裸骨fastx读取器

    v0.2.12 110 #生物信息学 #测序 #dna
  10. flowtigs

    在宏基因组DNA读取的De Bruijn图上计算flowtigs的算法

    v1.1.0 130 #图算法 #de #dna #算法 #读取 #计算 #bruijn
  11. minimizer-iter

    遍历DNA序列的最小化器

    v1.2.1 #迭代器 #dna #生物信息学 #最小化器
  12. disambiseq

    创建明确的单次不匹配的DNA序列库

    v0.1.11 170 #生物信息学 #dna #不匹配 #测序
  13. 核苷

    生物信息学:核苷酸和氨基酸统计

    v1.1.1 #生物信息学 #遗传 #dna #rna #蛋白质 #统计分析 #序列
  14. classeq-core

    classeq项目的核心库

    v0.10.0 1.5K #定位 #dna #生物信息学 #系统发育
  15. base_sequence_compression

    压缩和解压缩DNA序列

    v0.1.2 130 #dna #序列 #压缩 #存储 #基础 #比特 #解压缩
  16. classeq-ports-lib

    用于在Classeq端口间共享元素的基库

    v0.10.0 1.5K #定位 #dna #生物信息学 #系统发育
  17. lightdock

    基于GSO算法的大分子对接软件

    v0.3.2 #生物信息学 #对接 #算法 #大分子 #评分 #gso #dna
  18. seqkmer

    序列kmer

    v0.1.0 #k-mer #序列 #生物信息学 #dna #基因组学
  19. sequence_domain

    DNA/RNA序列域

    v0.2.0 260 #序列 # #rna #dna #dna-rna #抽象
  20. ecdna-lib

    ecDNA的进化分布(ecDNA)

    v3.0.2 #进化 #dna #分布 #ec-dna
  21. debruijn

    DNA序列的工具:高效的k-mer操作,De Bruijn图构建和压缩,以及DNA字符串的处理

    v0.3.4 200 #k-mer # #dna #测序
  22. seal

    Needleman-Wunsch & Smith-Waterman序列对齐

    v0.1.5 270 #序列对齐 #nlp #needleman-wunsch #dna #smith-waterman
  23. codenano

    编辑DNA分子设计

    v0.5.1 #dna #编辑 #分子 #核酸 #设计 #螺旋 #
  24. blutils-proc-adapter

    更容易运行和分析Blast结果

    v8.2.0 1.6K #blast #生物信息学 #ncbi #dna #相似性分析
  25. codenano-server

    在浏览器中编辑DNA分子设计

    v0.4.0 #nucleotide #dna #molecular #browser #editing #codenano #design
  26. prot_translate

    将核酸序列翻译成蛋白质

    v0.1.0 #translate #protein #dna #rna #bioinformatics
  27. frag_gene_scan_rs

    适用于短读段和易出错的基因预测模型

    v1.1.0 #gene #dna #protein
  28. diploid-contam-estimator

    估算二倍体DNA测序库中的污染水平

    v0.3.4 #variant #level #contamination #dna #diploid #estimating #calls
  29. sbwt

    使用谱Burrow-Wheeler变换对DNA k-mer集合进行索引

    v0.3.1 #k-mer #dna #indexing #structure #transform #set #data-structures
  30. genome

    用于生成GAN生成器的DNA的包

    v0.3.0 #dna #random #sequence #generate #generator #gan #create
  31. partialdebug

    部分调试

    v0.2.0 #debugging #specialization #partially #traits #dna #detection #type
  32. cadnano-format

    Cadnano使用的格式的接口,用于表示DNA折纸设计

    v0.1.0 #format #dna #designs #cadnano #codenano #origami #strands
  33. links

    从html和javascript中查找链接 🧬

    v0.1.0 #javascript #html #link #find #🧬
  34. basebits

    将DNA编码到u64中,以允许进行恒定时间的汉明距离计算

    v1.2.0 100 #constant-time #dna #hamming #distance #calculations #encoding #u64
  35. blutils-core

    更容易运行和分析Blast结果

    v8.2.0 #blast #bioinformatics #ncbi #dna #similarity-analysis
  36. nucleobases

    低级砖块库,用于将核苷酸作为数据在代码中管理

    v1.1.0 #genomics #dna #data #low-level #nucleobase #convert #brick
  37. protein-translate

    将核酸序列翻译成蛋白质

    v0.2.0 #translate #protein #dna #rna #bioinformatics
  38. holochain_scaffolding_cli

    CLI工具,用于轻松生成和修改holochain应用

    v0.4000.0-dev.15 500 #holochain #scaffold #scaffolding #zome #dna #apps #generate
  39. sdust

    对称DUST算法,可选的CLI版本

    v0.1.0 120 #dna #sequence #bio #region
  40. jean_blosum

    为jean提供的BLOSUM特征

    v0.1.0 #dna #protein #rna #matrix #blosum
  41. 尝试使用DuckDuckGo搜索

  42. dnas

    生成和解析DNA碱基

    v0.1.0 #dna #generate #parser #bases
  43. rust-spoa

    封装了C++ SPOA库以生成DNA和蛋白质一致性序列

    v0.2.4 #consensus #sequences #protein #dna #spoa #generate #partial
  44. multi-seq-align

    操作多个序列比对(DNA/蛋白质)

    v0.2.0 #bioinformatics #dna #protein #msa #alignment
  45. ncrs

    一个轻量级的Rust库,用于加载和存储核酸序列(DNA或RNA)及其注释,最小化依赖

    v0.1.1 #dna #rna #gff #bio
  46. rust-gc-count

    GC和序列工具

    v0.1.0 #fasta #gc #bio #sequence #wiggle #dna #command-line
  47. holochain_types

    Holochain常用类型

    v0.4.0-dev.20 2.8K #holochain #dna #types #zomes #version #depend #open
  48. rust-seq2kminmers

    从DNA序列构建和迭代k-min-mers

    v0.1.0 #bioinformatics #sequence #iteration #dna #iterator #position #space
  49. jean_cut

    为jean提供的密码子使用表功能

    v0.1.0 #cut #dna #protein #rna #codons
  50. ncbi

    Rust数据结构用于NCBI API

    v0.2.0-beta #biology #bioinformatics #dna #parser
  51. hc_deepkey_types

    Deepkey DNA Zomes使用的定义

    v0.8.0-dev.3 480 #definition #holochain #deepkey #dna #zomes #types
  52. links_js

    从JavaScript中抓取链接 🧬

    v0.1.0 #javascript #links #html #find #🧬 #scrape
  53. links_html

    从HTML中抓取链接 🧬

    v0.1.0 #html #links #javascript #scrape #find #🧬
  54. holochain_cli_bundle

    hc Holochain CLI 工具提供的 DNA 和 hApp 打包功能

    v0.4.0-dev.20 900 #holochain #holo #bundle #dna #subcommand #directory #hc
  55. gattaca

    使用DNA中发现的四种碱基(核苷酸)进行的 base4 编码

    v1.0.0 #nucleotide #bases #dna #found #four #base4 #encoding
  56. jean

    一个用于Rust的生物信息学实用程序库,包括序列比对、基因组注释和生物文件I/O

    v0.1.0 #biology #dna #rna #protein #bioinformatics #sequence-alignment
  57. hc_deepkey_sdk

    Deepkey DNA Zomes的SDK

    v0.7.0-dev.3 420 #dna #zomes #deepkey #sdk #holochain #github
  58. ksw2-sys

    为ksw2序列比对库提供的Rust绑定

    v0.1.0 #alignment #bindings #ksw2 #sequence-alignment #dna
  59. holochain_deepkey_dna

    用于Holochain的Deepkey DNA的集合

    v0.0.8-dev.1 450 #holochain #dna #deepkey #byte #bundle #compilation
  60. hc_portal_types

    Portal DNA Zomes使用的定义

    v0.15.0 170 #definition #portal #dna #zomes #type #zome
  61. nucleic-acids

    创建DNA和RNA序列

    v0.1.0 #rna #dna #sequences
  62. meow

    MEOW作为DNA的隐喻

    v0.2.2 #dna #metaphor #convert #digits #pass #stdin #decode
  63. li-stephens

    Li+Stephens模型,用于预测测试序列在给定参考单倍型集的概率

    v0.1.0 #dna #biology #genetic #sequence #model #reference #stephens
  64. jean_io

    为jean提供的I/O库功能

    v0.1.0 #fasta #rna #dna #protein #gff3
  65. jean_macros

    为jean提供的宏库功能

    v0.1.0 #rna #dna #protein
  66. dna

    一些工具目前因为不够精细和不稳定,所以是'内部'使用的,但被其他'公共'crate使用

    v0.1.3 #refined #unstable #insufficient #internal #now #documented #public
  67. orf

    将核酸序列转换为氨基酸序列。(RNA和DNA,调整阅读框并反转)

    v0.1.0 #sequences #frame #nucleotide #amino #acid #dna #rna