noodles-bam 处理BAM（二进制比对/映射）文件格式的读写。

BAM格式包含与SAM（序列比对/映射）相同的信息，即SAM头和记录列表。

示例

读取所有记录

use noodles_bam as bam;

let mut reader = bam::io::reader::Builder::default().build_from_path("sample.bam")?;
let header = reader.read_header()?;

for result in reader.records() {
    let record = result?;
    // ...
}

查询记录

查询允许通过区域过滤记录。它需要一个相关的BAM索引（BAI）。

use noodles_bam as bam;

let mut reader = bam::io::indexed_reader::Builder::default().build_from_path("sample.bam")?;
let header = reader.read_header()?;

let region = "sq0:5-8".parse()?;
let query = reader.query(&header, &region)?;

for result in query {
    let record = result?;
    // ...
}