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bio
Rust的生物信息学库。该库提供了许多对生物信息学以及其他领域有用的算法和数据结构实现。
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seq_io
快速解析FASTA、FASTQ和FASTX
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bigtools
读取和写入bigwigs和bigbeds的关联工具
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fqkit
用于快速操作fastq文件的跨平台程序
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sigalign
一种基于相似性的对齐算法
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lt-fm-index
使用k-mer查找表进行精确模式匹配的Fm索引
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matchtigs
计算kmer集的小型和最小纯文本表示的不同算法
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umgap
Unipept宏基因组分析管道
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pdbtbx
打开/编辑/保存(晶体学)蛋白质数据银行(PDB)和mmCIF文件
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rustyms
处理蛋白质组质谱数据,并将肽段匹配到光谱
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fakit
用于fasta文件操作的程序
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fastq
fastq的解析器
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gffkit
用于gff3文件操作的程序
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encryptodon
大象进入私人领域 🐘🕶️
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rustynuc
对可能8-oxoG位置的pileups进行快速分析
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sdust
对称DUST算法,可选的CLI
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ncrs
一个轻量级的Rust库,用于以最小依赖性加载和存储核酸序列(DNA或RNA)及其注释
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bio-rust
解析生物信息领域的基本数据结构,提供操纵这些数据的接口和构建一些统计模型。
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vcfkit
用于vcf/bcf文件操作的程序
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GetPDB
从rcsb.org下载蛋白质文件
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rust-gc-count
GC和序列工具
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mmtf
大分子传输格式(MMTF)解码器和编码器
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acetylene_parser
化学公式的解析器
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