#bio

  1. bio

    Rust的生物信息学库。该库提供了许多对生物信息学以及其他领域有用的算法和数据结构实现。

    v2.0.1 10 #生物信息学 #数据结构 #持续集成 #领域 #测试 #文档 #遵循
  2. seq_io

    快速解析FASTA、FASTQ和FASTX

    v0.4.0-alpha.0 850 #fasta #fastq #数据处理 #bio #并行处理 #解析器
  3. bigtools

    读取和写入bigwigs和bigbeds的关联工具

    v0.5.2 1.0 #bigwig #bio #读取 #bigbeds #关联 #bigbed #big-wig
  4. fqkit

    用于快速操作fastq文件的跨平台程序

    v0.4.10 310 #fastq #读取 #read #bio #条形码 #hts
  5. sigalign

    一种基于相似性的对齐算法

    v0.4.0 #生物信息学 #核酸 #bio #对齐
  6. lt-fm-index

    使用k-mer查找表进行精确模式匹配的Fm索引

    v0.7.0-alpha.3 #模式匹配 #查找表 #bwt #bio #fm-index
  7. matchtigs

    计算kmer集的小型和最小纯文本表示的不同算法

    v2.1.8 330 #纯文本 #k-mer #基因组 #压缩 #bio #kmer
  8. umgap

    Unipept宏基因组分析管道

    v1.1.0 #宏基因组 #dna #unipept #bio #索引文件 #转录组学 #样本
  9. pdbtbx

    打开/编辑/保存(晶体学)蛋白质数据银行(PDB)和mmCIF文件

    v0.11.0 170 #pdb #蛋白质 #晶体 #bio #mmcif #科学计算
  10. rustyms

    处理蛋白质组质谱数据,并将肽段匹配到光谱

    v0.8.3 100 #spectra #fragmentation #bio #proforma #massspectrometry #compile-time
  11. fakit

    用于fasta文件操作的程序

    v0.3.8 150 #fasta #sequence #file-format #bio #fa #compression-level
  12. fastq

    fastq的解析器

    v0.6.0 500 #parser #bio #processing #records
  13. gffkit

    用于gff3文件操作的程序

    v0.1.2 #gff #bio #gene #hts
  14. encryptodon

    大象进入私人领域 🐘🕶️

    v0.1.8 #encryption-decryption #private #goes #generate-keys #pachyderm #web #bio
  15. rustynuc

    对可能8-oxoG位置的pileups进行快速分析

    v0.3.0 #bio #bioinformatics #8-oxo-g #oxo-g #pileup
  16. sdust

    对称DUST算法,可选的CLI

    v0.1.0 #dna #sequence #bio #region
  17. 尝试使用DuckDuckGo搜索搜索

  18. ncrs

    一个轻量级的Rust库,用于以最小依赖性加载和存储核酸序列(DNA或RNA)及其注释

    v0.1.1 #dna #rna #gff #bio
  19. bio-rust

    解析生物信息领域的基本数据结构,提供操纵这些数据的接口和构建一些统计模型。

    v0.1.1 #bio #fastq #parser
  20. vcfkit

    用于vcf/bcf文件操作的程序

    v0.1.1 #vcf #bio #snp #hts
  21. GetPDB

    从rcsb.org下载蛋白质文件

    v1.0.1 #getpdb #bio #biology #bioinformatics
  22. rust-gc-count

    GC和序列工具

    v0.1.0 #fasta #gc #bio #sequence #wiggle #dna #command-line
  23. mmtf

    大分子传输格式(MMTF)解码器和编码器

    v0.1.1 #bio #macromolecular #decoder #transmission #format #encoder #codec
  24. acetylene_parser

    化学公式的解析器

    v0.1.0 #regex-parser #parser #chemistry #regex #bioinformatics #bio #informatics