acetylene-parser

不同化学命名法的字符串解析器。

函数

• tokenize(字符串, 类型="公式") ->物质

  将描述化学物质的字符串进行分词，生成一个包含（可选）官能团与（更）基本成分相对应的物质。

  • "formula"类型期望一个简单的"中学"元素符号命名字符串。

  • "smiles"期望使用SMILES系统的化学名称。

  • 待办事项："iupac"期望使用IUPAC系统的化学名称。

路线图

• 实现SMILES解析
• 根据SMILES的发现改进结构
• 决定InChI实现是否值得

参考文献

SMILES

• https://en.wikipedia.org/wiki/Simplified_molecular-input_line-entry_system
• http://opensmiles.org/opensmiles.html
• http://www.dalkescientific.com/writings/diary/archive/2004/01/05/tokens.html

IUPAC

• http://www.chem.uiuc.edu/GenChemReferences/nomenclature_rules.html
• https://web.archive.org/web/20100626004648/http://www.acdlabs.co.uk/iupac/nomenclature/93/r93_125.htm
• https://en.wikipedia.org/wiki/IUPAC_nomenclature_of_organic_chemistry
• https://bitbucket.org/dan2097/opsin/src

InChI

• http://iupac.org/who-we-are/divisions/division-details/inchi/
• http://www.inchi-trust.org/downloads/

数据

• http://www.chemicalize.org/blog/
• http://www.chemspider.com/