#fastq #parser

bio-rust

解析生物信息领域的基本数据结构,提供操作这些数据的接口和构建一些统计模型。

1 个不稳定版本

0.1.1 2022年8月11日

#297 in 生物学

MIT 许可证

7KB
161

生物-Rust

这个库是本人学习Rust的一个练习库,旨在通过阅读优秀的代码,根据相关理论模型,动手实现相关功能,以加深对相关知识的理解和应用。

  • 常用数据结构
  • 解析生物信息学数据文件结构
  • 实现生物信息分析数据模型

常用的数据结构

解析生物信息学的数据结果

  1. fastq文件格式的解析;
  2. vcf文件格式的解析;
  3. bed文件格式的解析;

模型算法

使用多线程的方式实现并行计算


lib.rs:

bio-rust

解析生物信息领域的基本数据结构,提供操作这些数据的接口和构建一些统计模型。

依赖

~315KB