3 个版本
使用旧的 Rust 2015
0.1.2 | 2020 年 3 月 10 日 |
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0.1.1 | 2020 年 3 月 9 日 |
0.1.0 | 2020 年 3 月 4 日 |
#7 在 #secondary-structure
在 phyloalifold 中使用
150KB
727 行
PhyloFold 程序,预测同源物之间 RNA 单次级结构以纳入系统发育
安装
此项目主要使用 Rust 编写,一种系统编程语言。因此,首先您需要安装 Rust 编译器、包管理器和标准库。访问 Rust 网站 了解有关该语言的更多信息。您可以使用以下一行命令安装这三个组件
$ curl https://sh.rustup.rs -sSf | sh
上述安装是通过 Rustup 完成的,因此您可以轻松地切换编译器进行使用。现在您可以使用以下方式安装 PhyloFold 程序
$ cargo install phylofold
按照以下方式检查此程序是否已正确安装
$ phylofold # Its available command options will be displayed.
测试后,可以在 PhyloFold 程序的论文中重现所显示的图
$ cd src
$ ./run_all.py # Install python packages required to the reproduction. Saved figures will appear at the "../assets/images" directory.
作者
许可证
版权 (c) 2018 Heartsh
根据 MIT 许可证 许可。
依赖项
~61MB
~1.5M SLoC