PhyloAliFold 程序，用于预测同源物之间的 RNA 一致性二级结构

安装

此项目主要使用 Rust 语言编写，这是一种系统编程语言。因此，首先您需要安装 Rust 编译器、包管理器和标准库。访问 Rust 网站 了解有关此语言的更多信息。您可以使用以下单行命令安装这 3 个组件：

$ curl https://sh.rustup.rs -sSf | sh

上述安装是通过 Rustup 完成的，因此您可以轻松切换编译器进行使用。此外，您还需要安装 Centroid RNA 包 以通过 RNAalipfold 算法预测配对概率。现在您可以按照以下方式安装 PhyloAliFold 程序：

$ cargo install phyloalifold

按照以下方式检查此程序是否已正确安装：

$ phyloalifold # Its available command options will be displayed.

测试后，PhyloAliFold 程序论文中显示的图可以重现

$ cd src
$ ./run_all.py # Install python packages required to the reproduction. Saved figures will appear at the "../assets/images" directory.

作者

Heartsh

许可证

版权 (c) 2018 Heartsh
在 MIT 许可证 下授权。