PhyloProb 程序，用于预测 RNA 结构比对的平均后验概率

安装

此项目主要用 Rust 编写，一种系统编程语言。因此，首先您需要安装 Rust 编译器、包管理器和标准库。访问 Rust 网站 了解有关此语言的信息。您可以使用一行命令安装这些组件

$ curl https://sh.rustup.rs -sSf | sh

安装由 Rustup 管理，它使得切换编译器变得容易。现在您可以安装 PhyloProb 程序

$ cargo install phyloprob

检查程序是否已正确安装

$ phyloprob # Its available command options will be displayed.

您可以使用准备的 RNA 同源序列测试集运行程序

$ git clone https://github.com/heartsh/phyloprob && cd phyloprob
$ cargo test --release -- --nocapture

测试后，可以重现程序论文中显示的图表

$ cargo test --release --nocapture
$ cd src
$ ./print_color_coded_csss_with_sas.py # Install python packages required to the reproduction. Saved figures will appear at the "../assets/images" directory.

作者

Heartsh

许可证

版权 (c) 2018 Heartsh
许可协议为 MIT 许可协议。