3 个版本
0.1.4 | 2024 年 7 月 10 日 |
---|---|
0.1.3 | 2024 年 1 月 10 日 |
0.1.2 | 2023 年 12 月 20 日 |
0.1.1 |
|
0.1.0 |
|
#122 在 生物学
215KB
1.5K SLoC
Podders
[!NOTE] Pod 大王即将到来 Pronounced pɒdəɹz
一个非常简单的原生 Rust 库,用于编写 POD5 文件。无 FFI Woooooooo 让我们出发吧
限制
很多!
- ** 未压缩信号** - 我在 7 天内把它冲了出来,所以目前我们仅限于未压缩信号。
- 仅写入 - 再次做到了我需要做的事情。我希望能在某一天添加更多功能,但现在我们只能这样。
示例用法
fn test() -> arrow::error::Result<()> {
let mut pod5 = Pod5File::new("test_builder.pod5").unwrap();
pod5.push_run_info(dummy_run_info());
pod5.write_run_info_to_ipc();
println!("{:#?}", pod5.run_table.length);
let read = dummy_read_row(None).unwrap();
let read_2 = dummy_read_row(Some("9e81bb6a-8610-4907-b4dd-4ed834fc414d")).unwrap();
pod5.push_read(read);
pod5.push_read(read_2);
pod5.write_reads_to_ipc();
// println!("{:#?}", pod5._signal);
pod5.write_signal_to_ipc();
pod5.write_footer();
Ok(())
}
变更日志
V0.1.1
- 将 RunInfoData 和 ReadInfo 结构体的字段设置为公共的 - 哎呀!
依赖项
~12–19MB
~260K SLoC