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› 关键词 #生物信息学 #CRISPR #深度 #d4 #文件格式 #DNA #读取 #基因组学

#序列化

  1. rust-htslib

    HTSlib 绑定和读取/写入 BAM 文件的高级别 Rust API

    v0.47.0 3.4K #bam #生物信息学 #序列化 #htslib #pileup

  2. d4-framefile

    D4 文件格式的 Framefile 容器 crate

    v0.3.9 180 #d4 #文件格式 #深度 #序列化 #容器 #读取 #DNA

  3. sgcount

    快速灵活的 sgRNA 计数器

    v0.1.32 #crispr #生物信息学 #序列化 #sg-rna #cli

  4. fxtools

    一组命令行 Fasta/Fastq 工具

    v0.2.34 390 #生物信息学 #序列化 #cli

  5. d4-hts

    D4 使用的 htslib 绑定

    v0.3.9 260 #d4 #数据访问 #数据分析 #文件格式 #深度 #序列化 #磁盘空间

  6. ska

    分割 k-mer 分析

    v0.3.10 160 #k-mer #生物信息学 #序列化 #基因组学 #对齐

  7. d4tools

    D4 文件格式的 CLI 工具

    v0.3.9 #文件格式 #d4 #数据 #深度 #数据分析 #序列化 #读取

  8. barcode-count

    DEL, CRISPR-seq 和 Barcode-seq 的 NGS 条码计数器

    v0.11.1 #barcode #序列化 #格式文件 #计数 #数据 #del #计数的

  9. fxread

    为 rust 设计的裸骨 fastx 读取器

    v0.2.12 110 #生物信息学 #序列化 #dna

  10. disambiseq

    为 DNA 序列创建无歧义的单一不匹配库

    v0.1.11 170 #生物信息学 #dna #不匹配 #序列化

  11. hts-sys

    HTSlib 绑定

    v2.1.4 3.5K #生物信息学 #bam #序列化 #htslib #pileup

  12. slow5

    与 slow5 交互

    v0.11.0 #生物信息学 #测序 #纳米孔 #基因组学 #信号 #文件 #记录

  13. fastx

    以最小开销读取Fasta和FastQ文件

    v0.2.1 #fasta #fastq #生物信息学 #测序 #基因组 #低开销

  14. geopagg

    sgRNAs跨基因分组的p值聚合算法

    v0.1.3 290 #测序 #crispr #生物信息学 #sg-rna

  15. genomicsqlite

    SQLite的基因组扩展

    v0.9.4 #基因组学 #sqlite扩展 #生物信息学 #测序 #github #指南 #编程

  16. debruijn

    DNA序列工具：高效的k-mer操作，De Bruijn图构建和压缩以及DNA字符串处理

    v0.3.4 200 #k-mer #图 #dna #测序

  17. alpha-rra

    基因组群上的p值聚合算法

    v0.3.0 #生物信息学 #crispr #测序 #sg-rna

  18. podders

    使用原生Rust编写未压缩的Pod5文件。无FFI！PODDDDERS

    v0.1.4 #生物信息学 #测序 #纳米孔 #文件解析

  19. hts

    Rust对htslib的绑定

    v0.1.18 #d4 #深度 #测序 #读取 #cram #格式 #bam

  20. ngs

    处理下一代测序数据的命令行工具

    v0.4.0 #文件格式 #测序 #下一代 #索引文件 #质量 #命令行工具 #参考

  21. cgt_bacpop

    在泛基因组数据中标记核心和稀有基因

    v0.1.0 #基因组学 #生物信息学 #测序 #泛基因组

  22. slow5lib-sys

    对slow5lib C库的低级别绑定

    v0.9.1+slow5lib.1.1.0 310 #slow5lib #生物信息学 #低级别 #包装器 #计算生物学 #纳米孔 #测序

  23. casgen

    生成cas12 6-plex CRISPR序列的方法

    v0.1.4 #crispr #生物信息学 #测序 #cas12 #读取

  24. sequencer

    依赖图处理库

    v0.1.1 #图 #测序 #游戏开发

  25. intc

    *-INC方法计算CRISPR筛选中非靶向控制的经验FDR

    v0.3.3 110 #crispr #测序 #生物信息学 #sg-rna

  26. casmap

    用于统计和描述cas12 6-plex CRISPR筛选构建的方法

    v0.1.3 #crispr #生物信息学 #测序 #cas12

  27. audact

    简约合成和测序库

    v0.5.1 #测序 #合成 #库 #简约 #处理 #备注 #系统

  28. markov-flow

    利用马尔可夫链中的流量进行（邻接）矩阵计算的分析图

    v0.3.2 #邻接矩阵 #矩阵 #图 #聚类 #测序 #概率 #马尔可夫链

    29. 尝试使用DuckDuckGo进行搜索。

  29. ratio-markov

    利用马尔可夫链中的流量进行（邻接）矩阵计算的分析图

    v0.3.2 #邻接矩阵 #矩阵 #图 #聚类 #测序 #概率 #马尔可夫链

  30. illumina_coordinates

    解析在FASTQ文件中发现的Illumina序列标识符

    v0.9.1 #fastq #测序 #illumina #生物信息学 #champ

  31. omics-tools

    一套用于处理高通量测序数据的程序。例如：Fastq/Bam/VCF文件。

    v0.1.0 #测序 #套件 #程序 #数据 #文件 #fastq-bam-vcf #omics