#crispr #sequencing #bioinformatics #sg-rna

intc

实现 *-INC 方法以计算 CRISPR 筛选中非靶向控制的经验假发现率。

10 个版本

0.3.3 2023 年 5 月 22 日
0.3.2 2023 年 5 月 22 日
0.2.1 2023 年 5 月 17 日
0.1.4 2023 年 2 月 2 日

#4#sg-rna

每月 25 次下载
用于 crispr_screen

MIT 许可证

45KB
1K SLoC

intc

Including Non-Targeting Controls

这是一个库,用于执行曼-惠特尼 U 检验,以聚合基因水平的 sgRNA 富集 p 值,并通过伪基因(由非靶向控制组成)的bootstrap 来计算经验假发现率。

依赖项

~9MB
~166K SLoC