#rna #生物信息学 #二级结构 #序列比对

程序+库 RNA算法

RNA生物信息学算法库

38个版本

使用旧Rust 2015

0.1.37 2023年2月24日
0.1.35 2022年11月23日
0.1.32 2022年6月19日
0.1.29 2022年3月16日
0.1.6 2018年3月19日

#291 in 生物学

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MIT 许可证

22MB
2.5K SLoC

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RNA生物信息学算法库

此库提供RNA生物信息学的基本算法。当前可用的算法包括gamma质心结构估计器McCaskill算法Durbin算法。为了模型RNA二级结构评分,提供了Turner 2004模型RSU2模型RNAstructure模型

Gamma-centroid estimator performance of different models and different implementations

作者

Heartsh

许可

版权(c)2018 Heartsh
在MIT许可证下许可

依赖

~36MB
~1.5M SLoC