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› 关键字 #生物信息学 #算法 #编辑距离 #生物 #字节 #绑定

#sequence-alignment

  1. biodiff

    使用序列比对比较二进制文件

    v1.2.1 700 #binary-file #sequence-alignment #byte #algorithm #hex #compare #reverse-engineering

  2. block-aligner

    使用自适应块算法计算全局和X-drop斜距序列到序列或序列到轮廓比对，并使用SIMD加速的库

    v0.5.1 #simd #sequence-alignment #biology #edit-distance #alignment #string-distance

  3. nail

    比对推断工具

    v0.2.0 #sequence-alignment #protein #biological #inference #m-mseqs2 #tool #find

  4. segul

    一个用于系统发育基因组学的超快速和内存高效的工具

    v0.22.1 350 #genomics #sequence-alignment #utility #command-line-tool #phylogenomics #alignment #cli

  5. align-cli

    一个命令行界面，可以轻松地对齐序列

    v0.4.0 #mass-spectrometry #sequence-alignment #modification #pairwise #complex #information #line

  6. pseqsid

    计算多重序列比对中蛋白质的成对序列身份、相似度和归一化相似度得分

    v1.0.2 #sequence-alignment #similarity #identity #protein-sequences #similarity-score

  7. noodles-sam

    序列比对/映射（SAM）格式读取器和写入器

    v0.63.0 3.9K #sam #sequence-alignment #header #bioinformatics #record #file-format #reader-writer

  8. biodiff-align

    biodiff的序列比对绑定

    v1.2.1-preview 110 #alignment #byte #algorithm #sequence-alignment #bindings #parameters #biodiff

  9. rna-algos

    RNA生物信息学算法

    v0.1.37 310 #rna #bioinformatics #secondary-structure #sequence-alignment

  10. seqalign

    使用编辑操作进行序列比对

    v0.2.3 550 #sequence-alignment #levenshtein #operations #edit-distance #measure #slice #following

  11. seal

    Needleman-Wunsch & Smith-Waterman序列比对

    v0.1.5 270 #sequence-alignment #nlp #needleman-wunsch #dna #smith-waterman

  12. bamrescue

    检查二进制序列比对/映射（BAM）文件是否损坏并修复它们

    v0.3.0 #bam #data-integrity #check #data-file #integrity #sequence-alignment #repair

  13. libnail

    执行轮廓隐马尔可夫模型（PHMM）生物序列比对

    v0.2.0 #sequence-alignment #model #markov #hidden #profile #biological #phmm

  14. nale

    执行轮廓隐马尔可夫模型（PHMM）生物序列比对

    v0.1.2 #sequence-alignment #biological #model #markov #hidden #phmm #profile

  15. sigalign-utils

    核心工具

    v0.2.0 120 #sequence-alignment #bioinformatics #algorithm #similarity-guided #ngs

  16. rust_wfa

    波前序列比对算法

    v1.0.0 #sequence-alignment #algorithm #wavefront #score #regions #data #memory

  17. edlib_rs

    到C++ edlib库的接口

    v0.1.2 #edlib #bindings #edit-distance #ffi #sequence-alignment #string-representation

  18. biogarden

    一组基本生物信息学算法

    v0.1.0 #sequence #bioinformatics #sequence-alignment #algorithm #ds #seq #pattern

  19. sigalign-core

    sigalign的核心crate

    v0.2.0 120 #sequence-alignment #sigalign #bioinformatics #algorithm

  20. splici

    为序列比对生成拼接和未拼接的参考转录本

    v0.1.1 #bioinformatics #genomics #single-cell #splicing #sequence-alignment

    21. 尝试使用DuckDuckGo搜索搜索。

  21. sigalign-impl

    核心的实现

    v0.2.0 #algorithm #sequence-alignment #bioinformatics

  22. jean

    Rust的计算生物学实用程序库，具有序列比对、基因组注释和生物文件I/O功能

    v0.1.0 #biology #rna #dna #protein #bioinformatics #annotations #sequence-alignment

  23. ksw2-sys

    Rust 对 ksw2 序列比对库的绑定

    v0.1.0 #alignment #bindings #ksw2 #sequence-alignment #dna

  24. count_constant_sites

    计算在(FASTA)多重序列比对中恒定位点的案例数量

    v0.1.1 #sequence-alignment #count #constant #sites #fasta #multiple #tool

  25. parasailors

    使用 SIMD 加速的成对遗传序列比对

    v0.3.1 #sequence-alignment #simd #sequence #bioinformatics #alignment

  26. jean_alignment

    jean 的序列比对功能

    v0.1.0 #sequence #rna #dna #protein #sequence-alignment #alignment

  27. parasail-sys

    对 parasail 成对遗传序列比对库的原生绑定

    v0.2.5 #sequence #sequence-alignment #simd #bioinformatics #alignment #native-bindings

  28. smith_waterman

    Smith-Waterman 算法执行局部序列比对

    v0.1.1 #sequence-alignment #sequence #alignment #waterman #smith