#序列比对 #模型 #隐藏 #马尔可夫 #轮廓 #生物 #PHMM

libnail

Libnail是一个执行轮廓隐马尔可夫模型(PHMM)生物序列比对的库

2个不稳定版本

0.2.0 2024年7月12日
0.1.0 2024年1月28日

#227 in 生物学

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91 每月下载次数
nail 中使用

BSD-3-Clause

310KB
6.5K SLoC

libnail

关于

libnail是一个执行轮廓隐马尔可夫模型(PHMM)生物序列比对的库。

此库处于早期开发阶段。API应该被视为高度不稳定,且缺少文档。

安装

要从源代码构建libnail,您首先需要安装Rust和Cargo。最简单的方法是使用rustup

完成此操作后,您就可以构建nale

git clone https://github.com/TravisWheelerLab/nail
cd nail/
cargo build --release

许可协议

libnail遵循BSD-3-Clause许可协议。

有关详细信息,请参阅LICENSE

作者

Jack Roddy - [email protected]

依赖项

~4–6.5MB
~116K SLoC