#rna #生物信息学 #二级结构

bin+lib conshomfold

ConsHomfold,用于预测全局单RNA二级结构,考虑稀疏全局成对RNA结构比对

2 个版本

使用旧 Rust 2015

0.1.1 2020年11月13日
0.1.0 2020年7月13日

#6 in #secondary-structure

MIT 许可证

17MB
1.5K SLoC

Python 1K SLoC // 0.0% comments Rust 251 SLoC // 0.1% comments

ConsHomfold,用于预测全局单RNA二级结构,考虑稀疏全局成对RNA结构比对

安装

此项目主要使用 Rust 编写,这是一种系统编程语言。您需要安装 Rust 组件,包括 rustc(Rust 编译器)、cargo(Rust 软件包管理器)和 Rust 标准库。访问 Rust 网站 了解更多关于该语言的信息。您可以使用以下单行命令安装组件

$ curl --proto '=https' --tlsv1.2 -sSf https://sh.rustup.rs | sh

上述安装是通过 Rustup 完成的,因此您可以轻松切换编译器。您可以按照以下步骤安装 ConsHomfold

$ cargo install conshomfold

按照以下方式检查程序是否正确安装

$ conshomfold # Its available command options will be displayed.

程序论文中显示的图表可以重现

$ cd src
$ ./run_all.py # Install python packages required to the reproduction. Saved figures will appear at the "../assets/images" directory.

作者

Heartsh

许可证

版权 (c) 2018 Heartsh
许可协议:MIT 许可证

依赖关系

~59MB
~1.5M SLoC