Rustbustools

Rust 库，用于与 scRNAseq 数据的 kallisto/bus 格式交互（见 bustools）。目前，这个包已经相当成熟，但与原始的 bustools 相比，可能缺少一些小的功能。

还有一个模仿 bustools 的 CLI，见 bustools_cli

示例

更多示例，请参阅 rust-docs。

迭代 bus 文件

use bustools::io::{BusReader};
let bus = BusReader::new("/tmp/some.bus");
for record in bus {
    // record.CB, record.UMI ...
}

按细胞迭代 bus 文件

use bustools::io::BusReader;
use bustools::iterators::CellGroupIterator; //need to bring that trait into scope

let breader = BusReader::new("/path/to/some.bus");
for (cb, vector_of_records) in breader.groupby_cb() {
    // Example: the number of records in that cell
    let n_molecules: usize = vector_of_records.len();
}