libradicl

Libradicl是一个Rust库，用于读取（最终可能还会写入和操作）简化对齐数据（RAD）格式文件。这些文件由salmon在准备使用alevin-fry进行单细胞量化时的数据进行生成。

目前，libradicl主要是在支持alevin-fry的情况下开发的，所以它还没有作为一个通用的库完全开发。最终，我们预计API将进行重组和稳定。

lib.rs:

libradicl是一个用于读取（和写入）RAD（简化对齐数据）格式文件的crate。RAD格式是一种二进制格式，用于编码关于测序读数和它们如何映射到一组目标（基因组、宏基因组、转录组等）的对齐信息。该格式被称为“简化”，因为它允许包含比例如SAM格式文件更稀疏的信息。

虽然这个crate的最终目标是为读取和写入可能用于任何目的的RAD文件提供通用的API，但它主要是由我们（COMBINE-lab）在创建使用RAD格式的工具（例如alevin-fry和piscem-infer）中的需求驱动的。因此，功能通常按照对这些工具开发最紧迫的顺序开发和添加。然而，我们欢迎通过pull请求的外部贡献，并乐意讨论您对RAD格式的潜在用途，以及它们如何得到支持。

此crate被分解为多个组件，覆盖了RAD文件的各个部分，包括类型标签系统、头部和主要数据块。每个模块的名称相对容易理解。