RNA测序

  1. oarfish

    一个快速、准确且通用的长读长转录组量化工具

    v0.6.1 250 #数据分析 #RNA测序 #量化 #长读长 #转录组 #默认值
  2. simpleaf

    一个简化alevin-fry使用的框架

    v0.17.1 200 #预处理 #单细胞 #RNA测序 #RNA速度 #单核
  3. alevin-fry

    一套用于快速、准确和节省内存的单细胞和单核测序数据处理工具

    v0.9.0 300 #单细胞 #RNA测序 #预处理 #单核 #RNA速度 #数据处理 #生成
  4. bustools

    与scRNAseq数据的kallisto/bus格式交互

    v0.14.1 750 #bus #kallisto #单细胞 #RNA测序 #scrnaseq
  5. radtk

    用于处理RAD文件的工具包

    v0.2.0 110 #预处理 #RNA测序 #单细胞 #rad文件 #文件输入 #预处理 #json格式
  6. bustools_cli

    为scRNAseq处理重写的bustools的Rust实现

    v0.5.1 210 #bus #单细胞 #RNA测序 #kallisto #命令行界面 #scrnaseq
  7. libradicl

    alevin-fry的支持库

    v0.9.0 #预处理 #单细胞 #RNA测序 #单核 #RNA速度 #读写 #文件格式
  8. piscem-infer

    一个灵活的工具,用于从全测序数据中进行目标量化

    v0.6.0 #RNA测序 #量化 #科学 #rad文件
  9. sce

    导入和管理各种单细胞矩阵

    v0.2.0 #单细胞 #RNA测序 #atac-seq
  10. simplr

    一个增强的执行上下文,用于简化长读长转录组分析

    v0.1.0 #生物信息学 #基因组学 #长读长 #RNA测序
  11. seq_geom_xform

    将复杂的单细胞片段几何形状转换为简单的几何形状

    v0.4.0 #预处理器 #单细胞 #RNA测序
  12. 尝试使用DuckDuckGo进行搜索

  13. seq_geom_parser

    用于解析单细胞测序库几何规范的简单crate。

    v0.3.0 #预处理器 #单细胞 #RNA测序 #预处理器