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› 关键词 #生物信息学 #基因组 #DNA #微生物组 #BAM #读段 #排序 #输出格式

##宏基因组学

  1. kun_peng

    Kun-peng：适用于所有样本的超快、低内存占用且准确的分类器

    v0.6.11 330 #生物信息学 #暴露组 #宏基因组学 #微生物组 #块大小 #输出格式 #排序

  2. coverm

    宏基因组读段覆盖计算器

    v0.7.0 #覆盖 #读段 #宏基因组学 #BAM #计算器 #基因组 #DNA

  3. nohuman

    从测序运行中移除人类读段

    v0.1.1 150 #生物信息学 #宏基因组学 #污染 #基因组

  4. umgap

    Unipept宏基因组分析管道

    v1.1.0 #宏基因组学 #DNA #unipept #生物 #索引文件 #转录组学 #样本

  5. ncbi_dl

    下载ncbi基因组文件

    v0.1.8 250 #ncbi #生物信息学 #宏基因组学 #微生物组

  6. jam-rs

    Rust中的另一个（基因组）minhash（Jam）实现

    v0.1.0-beta.2 #min-hash #生物信息学 #宏基因组学 #Jaccard #包含

  7. lorikeet-genome

    通过局部组装进行宏基因组菌株解析和变异调用

    v0.8.2 #生物信息学 #宏基因组学 #变异调用 #菌株分析 #生物信息学-宏基因组学 #生物信息学-变异调用 #生物信息学-菌株分析

  8. kractor

    根据Kraken2的物种分类从FASTQ文件中提取读段

    v0.4.0 #fastq #生物信息学 #文件读取 #kraken #宏基因组学 #分类学

  9. lorikeet-rs

    宏基因组菌株解析器

    v0.3.0 #解析器 #读段 #菌株 #宏基因组学 #参考 #BAM #基因组

  10. krakenxtract

    根据Kraken2的物种分类从FASTQ文件中提取读段

    v0.4.0 #fastq #生物信息学 #宏基因组学 #kraken #分类学

    11. 尝试使用DuckDuckGo进行搜索。搜索.

  11. bracken

    基于Rust的Bracken库实现，用于增强基于k-mer的基因组丰度估计

    v0.1.0 #生物信息学 #k-mer #宏基因组学 #估计 #基因组 #丰度 #数量