1个不稳定版本
新 0.1.0 | 2024年8月21日 |
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#303 in 神奇豆子
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49KB
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Bracken-rust
0.安装说明
要安装bracken-rust,请按照以下步骤操作
- 下载适合您系统的版本
导航到bracken-rust GitHub仓库的发布页面。选择适合您的操作系统的版本。例如,如果您使用的是CentOS 7,请下载bracken-rust-${VERSION}-centos7.tar.gz,其中${VERSION}是要安装的版本的版本号。
- 解压下载的压缩包
打开终端。使用tar命令从压缩包中提取文件
tar -xvf bracken-rust-${VERSION}-centos7.tar.gz
1. 开始使用
$ ./bracken -h
Usage: bracken <COMMAND>
Commands:
kmer2read-distr bracken kmer2read_distr
kmer-distrib Evaluates genome read distribution and estimates reads per species for specific taxonomy IDs.
est-abundance Estimates species or genus level abundance from Kraken outputs using Bayesian methods.
help Print this message or the help of the given subcommand(s)
Options:
-h, --help Print help
-V, --version Print version
依赖项
~5–11MB
~117K SLoC