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› 关键词 #gtf #gtf-gff #cli #file-format #bed #bioinformatics #exon #convert

#gff

tuni

统一不同样本中的转录本

v0.1.1 #gtf-gff #gtf #gff #转录本组装
noodles-gff

通用特征格式（GFF）读取器和写入器

v0.35.0 1.6K #gff #生物信息学 #格式 #noodles #file-format #file-io #通用
bed2gff

BED-to-GFF3并行转换器

v0.1.5 #bed #gff3 #gff #bed2gff3 #cli
gxf2bed

最快的GTF/GFF-to-BED转换器

v0.2.2 #gtf-gff #bed #gtf #convert #gff
gffkit

用于gff3文件操作的程序

v0.1.2 #gff #生物 #基因 #hts
noel

一个基于基因的非重叠外显子长度计算器

v0.2.1 #length #exon #gtf-gff #gff #gtf #cli
exon-gff

使用Exon读取和写入GFF文件

v0.31.0 600 #exon #gff #生物信息学 #数据 #读取 #file-format #arrow
serde-gff

https://github.com/Mingun/serde-gff

v0.3.0 #gff #序列化 #serde #parser #生物软件
to-trans

从fasta + GTF/GFF构建高性能转录组

v0.2.0 #gtf-gff #fasta #gtf #gff #转录组 #命令行工具
gxf2chrom

从GTF/GFF中获取所有.chrom内容

v0.1.0 #gtf-gff #gtf #gff #convert #chrom #cli
gene-seq-intersections

计算基因和序列之间的交集

v0.3.1 #gene #gff #sequences #blast #intersection #overlap #length
ncrs

A lightweight Rust library for loading and storing nucleic acid sequences (DNA or RNA) and their annotations with minimum dependences

v0.1.1 #dna #rna #gff #bio

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