fastix

一个简单的命令行工具，用于向FASTA头部添加前缀。该工具旨在支持全基因组应用，遵循PanSN分层命名规范。

特性

• 向FASTA记录名称添加前缀
• 将序列转换为大写

用法

fastix [OPTIONS] <INPUT>

Arguments:
  <INPUT>             Input FASTA file

Options:
  -h, --help          Print help information
  -V, --version       Print version information
  -p, --prefix <STR>  Prefix to add to FASTA record names

示例

$ fastix -p "gen#1#" genome.fa > genome_prefixed.fa

这将把"gen#1#"作为前缀添加到genome.fa中所有的FASTA记录名称。

安装

cargo install fastix

许可证

本项目采用MIT许可证。请参阅LICENSE获取更多详细信息。