#生物信息学 #gff3 #fasta

程序 stats_on_gff3_ncbi

计算CDS GC3比率、内含子GC比率、侧翼基因区域GC比率、第一个内含子长度、内含子数量、CpG比率等统计信息

29个发布版本

0.1.52 2024年3月21日
0.1.51 2024年3月13日
0.1.41 2024年2月28日

生物学类别的第151位

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gff3文件统计信息

安装

cargo安装stats_on_gff3_ncbi

仓库: https://crates.io/crates/stats_on_gff3_ncbi

示例

stats_on_gff3_ncbi--精度1000example_ncbi.gff3 example_ncbi.fa2>err

zcat example_ncbi.fa.gz|stats_on_gff3_ncbi--精度100example_ncbi.gff3 stdin2>err

关于Ensembl数据,请参阅https://crates.io/crates/stats_on_gff3

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