26个版本
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| 0.1.25 | 2024年2月22日 |
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| 0.1.17 | 2023年7月28日 |
| 0.1.4 | 2023年4月28日 |
#64 in 生物学
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gff3文件统计数据
安装
cargo安装 stats_on_gff3
Crates: https://crates.io/crates/stats_on_gff3
示例
stats_on_gff3--精确度1000人.GRCh38.109.染色体.1.gff3 人.GRCh38.dna.染色体.1.fa2>错误
stats_on_gff3--所有 人.GRCh38.109.染色体.1.gff3 人.GRCh38.dna.染色体.1.fa2>错误
zcat Ciona_savignyi.CSAV2.0.dna.顶层.fa.gz|stats_on_gff3--精确度100Ciona_savignyi.CSAV2.0.109.gff3 stdin2>错误
输入数据
来自Ensembl的Gff文件及其关联的fasta文件。Fasta序列应为大写。（对于NCBI数据，请参阅stats_on_gff3_ncbi https://crates.io/crates/stats_on_gff3_ncbi）
依赖关系
~18MB
~318K SLoC