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0.31.0 2024年8月17日
0.29.1 2024年7月16日
0.15.0 2024年3月27日
0.5.5 2023年12月18日
0.5.3 2023年11月29日

#280 in 生物学

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每月下载 625次
4 个crate中使用 (通过 exon)

Apache-2.0

27KB
373

Exon

Exon是一个用于处理生物信息学数据的执行引擎。它具有以下特点:

  • 基于SQL访问生物信息学数据 -- 支持通用的DML和一些DDL
  • 支持来自生物信息学、蛋白质组学和其他领域的多种文件格式
  • 支持本地文件系统和对象存储
  • Arrow FFI原语以支持多语言

安装

Exon可通过crates.io获取。要安装,请运行

cargo add exon

文档

基准测试

请参阅 基准测试 README 获取更多信息。


lib.rs:

支持读取FASTQ文件的crate。

依赖项

~70MB
~1.5M SLoC