18个版本
0.3.4-beta.5 | 2023年10月16日 |
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0.3.4-beta.3 | 2023年10月11日 |
0.3.3-beta.1 | 2023年9月26日 |
0.2.7-rc.3 | 2023年9月12日 |
#234 in 生物学
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300 代码行
Exon基准测试
本页描述了Exon的基准测试。
UniProt非蛋氨酸氨基酸计数
这个基准测试展示了从uniprot中计数不以蛋氨酸开头的氨基酸的性能。
UniProt大约有56万个序列。
VCF查询
这个基准测试展示了查询2.6G VCF文件中的基因组区域。
BAM查询
这个基准测试展示了查询303M BAM文件中的基因组区域。与VCF查询基准测试相同。
MzML扫描
这个基准测试展示了扫描大约有6k谱图的MzML文件。
按文件并行FASTA扫描
这个基准测试展示了在不同并行级别下扫描8个FASTA文件。
依赖关系
~76MB
~1.5M SLoC