Exon 是一个专为生物信息学数据设计的执行引擎。它具有以下特点：

• 基于 SQL 访问生物信息学数据 -- 支持一般的 DML 和一些 DDL
• 支持来自生物信息学、蛋白质组学等多个领域的多种文件格式
• 支持本地文件系统和对象存储
• Arrow FFI 原语以支持多语言

安装

Exon 可通过 crates.io 获取。要安装，请运行

cargo add exon

文档

• Rust 文档在此处可用：here.
• 通用文档在此处可用：here.

相关项目

• Exon R 绑定
• BioBear

基准测试

请参阅 基准测试 和 README 以获取更多信息。

lib.rs:

Exon 是一个库，旨在促进对科学数据的开放式分析，简化 ML 模型的应用，并为科学和工程团队提供一个通用数据接口。

概述

用户的主要接口是通过 datafusion 的 SessionContext 加上 ExonSessionExt 扩展 trait。它提供了一些方便的方法来从各种来源加载数据。

有关更多信息，请参阅 ExonSessionExt 上的 read_* 方法。例如，read_fasta 或 read_gff。还有一个 read_inferred_exon_table 方法，它将尝试根据文件扩展名推断数据类型和压缩，以便于使用。

为了方便这些方法，Exon 为 DataFusion 实现了多个特性，这些特性是科学数据工作的良好基础。有关更多信息，请参阅 datasources 模块。