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phrace
xvg 文件终端图形查看器
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wham
加权直方图分析法
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gcenter
在 Gromacs 轨迹中对任何组进行中心化
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groslicer
通过处理一行流来切割 gro 文件
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molly
xtc 文件格式的快速读取器
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molar
分析 MD 轨迹和分子建模
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minitpr
读取 Gromacs TPR 文件
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groan_rs
Rust 的 Gromacs 分析库
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eightyseven
快速读取和写入 gro 文件
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molecules
处理分子和分子动力学模拟
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openmm-sys
使用高性能 GPU 代码进行分子模拟的 OpenMM 工具包的 Rust 绑定
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xtcat
快速 XTC 文件连接器
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velvet
注重用户友好性和扩展性的经典原子模拟引擎
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xdrfile
围绕gromacs libxdrfile库的包装。可用于读取和写入xtc和trr格式的gromacs轨迹。
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grafen
创建用于分子动力学模拟的石墨烯和其他衬底
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lammps-sys
生成LAMMPS C接口的绑定（可选从源码构建）
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EZAIMD
一个命令行工具，允许用户轻松运行与Gaussian16量子化学包接口的从头分子动力学（AIMD）
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velvet-cli
基于Velvet API构建的命令行工具
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fips-md
用于模拟任意粒子动力学的框架
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mbar-rs
pymbar的Rust绑定
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velvet-core
Velvet模拟引擎的核心功能库
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velvet-external-data
导入和导出外部数据格式
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molconv
在几种分子结构和轨迹文件格式之间进行转换
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trajan
分析分子动力学轨迹。目前处于预alpha阶段
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