#分子动力学 #分子 #模拟 # #算法 #PDB #文件

molecules

一个用于处理分子和分子动力学模拟的库

8 个版本

0.1.7 2024年4月14日
0.1.6 2024年4月11日
0.1.5 2024年3月22日

#353科学

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分子

一个用于处理分子的库。

功能

使用 VF2 算法高效实现子图匹配,以找到从分子 A 到分子 B 的映射。可以将 xyz 和 smiles 解析为内部分子图表示。在解析 xyz 文件时,根据分子坐标自动确定连接性。

待办事项:实现计划中要添加的格式解析:InChI mol sdf pdb。用纯 Rust 正规化算法替换 Openbabel。

依赖项

~7–34MB
~466K SLoC