seqcomplexity — Rust应用程序 // Lib.rs • Rust 包仓库

#314 in 生物学

MIT 许可证

19KB
84 行

从FastQ文件计算每读和总序列复杂度。

安装

下载源代码并运行

cargo install

seqcomplexity -q path/to/sequence.fastq

参数

参数	默认值	描述
-q --fastq	-	要使用的FASTQ文件的路径
-p, --per-read	false	报告每读的复杂度

~25–35MB
~618K SLoC