5个版本
| 0.1.4 | 2022年10月3日 |
|---|---|
| 0.1.3 | 2022年10月3日 |
| 0.1.2 | 2022年10月3日 |
| 0.1.1 | 2022年9月20日 |
| 0.1.0 | 2022年9月20日 |
#299 in 生物学
34KB
138 代码行
根据列表中的标题名称或正则表达式解析fasta记录
安装
源代码
下载源代码并运行
cargo install
用法
seqsplitter -f path/to/sequence.fastq -l path/to/list.txt
参数
| 参数 | 默认值 | 描述 |
|---|---|---|
| -f --fasta | - | 要使用的FASTQ文件的路径 |
| -l --list | - | 要解析的ID列表 |
| -r --regex | false | 将列表解释为正则表达式 |
| -u --assume_unique | false | 假设列表是唯一的，并在找到列表中的所有序列时退出 |
| -v --version | - | 打印版本信息 |
依赖项
~46MB
~804K SLoC