13 个稳定版本
使用旧的 Rust 2015
1.1.0 | 2017年6月20日 |
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1.0.11 | 2017年6月6日 |
1.0.9 | 2017年3月26日 |
1.0.8 | 2017年2月8日 |
1.0.7 | 2017年1月9日 |
#5 in #secondary-structure
在 crast 中使用
265KB
3.5K SLoC
CapR,高效的 RNA 环境概率估算器
此二进制文件提供了 Tsukasa Fukunaga 提出的 CapR 算法,一个高效的 RNA 环境概率估算器。它提供多线程版本,而原始二进制文件提供串行版本。您可以通过添加选项 "-h" 来检查所有可用选项。
安装
该项目是用 Rust 编写的,一种系统编程语言。因此,您首先需要安装 Rust 编译器(Rustc)、Rust 包管理器(Cargo)和 Rust 标准库。请访问 Rust 网站 了解更多信息。您可以使用以下一行代码进行安装:
$ curl https://sh.rustup.rs -sSf | sh
上面的安装是通过 Rustup 完成的,因此您可以轻松切换编译器以使用。现在,您可以通过以下方式安装 CapR:
$ cargo install --git https://github.com/heartsh/cpr
以下方式检查是否已正确安装:
$ cpr
如果您想了解它有多快,可以运行以下基准测试:
$ git clone https://github.com/heartsh/cpr && cd cpr
$ tar xvf asts.tar.bz2
$ cargo test --release -- --nocapture
作者
许可协议
版权 (c) 2016 Heartsh
在 MIT 许可协议 下授权。
依赖关系
~7.5MB
~118K SLoC