#fastq #read #counter #base #paired #data

app fastq-count

简单配对数据快速读取和碱基数计数器

1 个不稳定版本

0.1.0 2019年4月30日

5#paired

MIT 许可证

4KB

fastq-count

简单配对数据快速读取和碱基数计数器。

用法

运行计数器非常简单

fastq-count r1.fq r2.fq

Fastq文件可能被gzip压缩。如果是这样,它们的文件名必须以.gz结尾。

fastq-count返回简单的json,具有以下架构

{
  "reads": {"type": "integer"},
  "bases": {"type": "integer"}
}

许可证

MIT

依赖项

~12MB
~205K SLoC