#hdf5 #生物信息学 #ont #fast5

rm-frust5-api

牛津纳米孔技术FAST5文件的Rust封装

3个版本

0.0.3 2022年5月17日
0.0.2 2022年5月17日
0.0.1 2022年5月16日

#2537解析器实现

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MIT 许可证

7MB
258

包含 (ELF库, 3.5MB) vbz_plugin/libvbz_hdf_plugin_x86_64.so, (ELF库, 3MB) vbz_plugin/libvbz_hdf_plugin_aarch64.so, (Mach-o库, 515KB) vbz_plugin/libvbz_hdf_plugin.dylib, (Windows DLL, 210KB) vbz_plugin/vbz_hdf_plugin.dll

RM-FRUST5-API

使用Rust管理FAST5文件。


lib.rs:

这个crate封装了Python的ONT-FAST5-API的最基本功能,但是在Rust中!

警告

目前处于alpha阶段,且为特定用例编写,请谨慎使用。

目前仅支持读取和写入FAST5文件。它使用HDF5 crate处理HDF5文件,并将VBZ插件应用于文件。

依赖

~5MB
~105K SLoC