7个版本 (破坏性更新)
0.6.0 | 2023年12月13日 |
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0.5.1 | 2023年8月31日 |
0.4.0 | 2023年8月10日 |
0.3.0 | 2023年6月25日 |
0.1.1 | 2023年5月4日 |
5 in #motif
每月下载量33次
1.5MB
6K SLoC
🎼🧬 lightmotif-transfac

(⚠️ 已废弃) lightmotifcrate的TRANSFAC解析器实现。
🚨 TRANSFAC解析器已合并到lightmotif-io
crate中,请使用lightmotif_io::transfac
模块代替此crate。 🚨
🗺️ 概述
TRANSFAC数据库是一个包含转录因子及其结合位点的集合。它为单个转录因子或密切相关的小组提供位置权重矩阵。
此crate提供了一个解析器,用于将TRANSFAC结合位点加载到lightmotif
矩阵中,以便与加速搜索流程一起使用。有关更多信息,请参阅lightmotif
crate。
💭 反馈
⚠️ 问题跟踪器
发现错误?有增强请求?如果您需要报告或询问某些内容,请访问GitHub问题跟踪器。如果您正在报告错误,请尽可能提供有关问题的信息,并尝试在简单、易于复现的情况下重现相同的错误。
📋 更新日志
⚖️ 许可证
此库在开源MIT许可证下提供。
本项目管理员由Martin Larralde在欧洲分子生物学实验室的Zeller团队的博士项目中开发。