7个版本 (破坏性更新)

0.6.0 2023年12月13日
0.5.1 2023年8月31日
0.4.0 2023年8月10日
0.3.0 2023年6月25日
0.1.1 2023年5月4日

5 in #motif

每月下载量33次

MIT 许可证

1.5MB
6K SLoC

🎼🧬 lightmotif-transfac Star me

(⚠️ 已废弃) lightmotifcrate的TRANSFAC解析器实现。

Actions Coverage License Crate Docs Source Mirror GitHub issues Changelog

🚨 TRANSFAC解析器已合并到lightmotif-iocrate中,请使用lightmotif_io::transfac模块代替此crate。 🚨

🗺️ 概述

TRANSFAC数据库是一个包含转录因子及其结合位点的集合。它为单个转录因子或密切相关的小组提供位置权重矩阵

此crate提供了一个解析器,用于将TRANSFAC结合位点加载到lightmotif矩阵中,以便与加速搜索流程一起使用。有关更多信息,请参阅lightmotifcrate。

💭 反馈

⚠️ 问题跟踪器

发现错误?有增强请求?如果您需要报告或询问某些内容,请访问GitHub问题跟踪器。如果您正在报告错误,请尽可能提供有关问题的信息,并尝试在简单、易于复现的情况下重现相同的错误。

📋 更新日志

此项目遵循语义版本控制并提供更新日志,格式为保持更新日志

⚖️ 许可证

此库在开源MIT许可证下提供。

本项目管理员由Martin Larralde欧洲分子生物学实验室Zeller团队的博士项目中开发。

依赖项