一个用于k-mer操作的库
由 drtconway 拥有。
#204 in 生物学
62KB 2K SLoC
K-mer及其相关操作。
该库提供从序列中提取k-mer以及以有用方式操作它们的功能。底层表示为64位整数(u64),因此不支持该库中的k > 32。
u64
K-mer(在某些计算机科学背景下称为q-gram)是以无符号整数表示的DNA/RNA "字母"的k长度序列。遵循惯例,
具有互补碱基是位运算补数的良好特性。