2个不稳定版本

0.2.0 2023年10月6日
0.1.0 2023年10月5日

#455压缩

GPL-3.0-or-later

50KB
1.5K SLoC

K-mers及其相关操作。

此库提供了从序列中提取k-mer的功能,并以有用的方式操作它们。底层表示为64位整数(u64),因此此库不支持k > 32。

K-mers(在某些计算机科学场景中为q-gram)是以无符号整数表示的DNA/RNA "字母"的k长度序列。遵循常规做法,

  • "A" -> b00
  • "C" -> b01
  • "G" -> b10
  • "T" 或 "U" -> b11

具有互补碱基是位运算补码的优良性质。

无运行时依赖