一个用于k-mer操作的库
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#455 在 压缩
50KB 1.5K SLoC
K-mers及其相关操作。
此库提供了从序列中提取k-mer的功能,并以有用的方式操作它们。底层表示为64位整数(u64),因此此库不支持k > 32。
u64
K-mers(在某些计算机科学场景中为q-gram)是以无符号整数表示的DNA/RNA "字母"的k长度序列。遵循常规做法,
具有互补碱基是位运算补码的优良性质。