11 个版本

0.2.23 2024 年 5 月 6 日
0.2.22 2024 年 5 月 3 日
0.1.22 2023 年 11 月 20 日
0.1.21 2023 年 9 月 29 日

#169 in 生物学

MIT 许可证

2MB
6.5K SLoC

gia: 基因组区间算术

MIT licensed actions status Crates.io

摘要

gia 是一款免费开源的命令行工具,用于对基因组区间数据进行高效且可扩展的集合运算。

它受到开源命令行工具 bedtoolsbedops 的启发,并旨在成为两者的替代品。

gia 使用 rust 编写并通过 cargo 分发。它是一个基于 bedrs 的命令行工具,bedrs 是一个独立且抽象的基因组区间库。

安装

gia 通过 rust 软件包管理器 cargo 分发。

cargo install gia

您可以通过检查 gia 的帮助菜单来验证安装。

gia --help

安装 cargo

您可以通过以下链接中的说明安装 cargo此处

用法

您可以在 文档网站 上查看每个子命令的更多详细用法。

问题和贡献

gia 是由 Noam Teyssier 持续开发和完善的。

如果您对构建更多功能或希望参与其中,请随时联系我们!

请将所有问题提交给未来的贡献者。

依赖项

~20–28MB
~422K SLoC