DeepBioP

生物数据处理深度学习库

设置

Python

使用以下命令安装最新的deepbiop版本

pip install deepbiop

Rust

您可以从 crates.io 获取最新版本，或者如果您想使用最新功能和性能改进，可以将此仓库的 main 分支指向最新版本。

cargo add deepbiop --features fq

然后可以通过其重导出的名称导入每个启用的功能，例如

use deepbiop::fastq;

最低支持的Rust版本 (MSRV)

本项目遵循最低支持的Rust版本 (MSRV) 策略。最低支持的Rust版本 (MSRV) 为 1.75.0。我们确保本项目中的所有代码都与该版本或更高版本兼容，以保持稳定性和兼容性。

贡献 🤝

参与号召：生物数据处理深度学习库

我们兴奋地宣布启动了一个新的开源项目，专注于开发一个针对生物数据的深度学习处理库，该库具有前沿性。本项目旨在让研究人员、数据科学家和开发者能够利用深度学习的最新进展来分析和解释复杂的生物数据集。

项目概述

生物数据，如基因组序列、蛋白质组学和成像数据，为机器学习应用带来了独特的挑战和机遇。我们的库旨在提供一套全面的工具和算法，以简化使用深度学习技术进行生物数据的前处理、建模和分析。

主要功能

• 数据预处理：用于清理、归一化和增强生物数据的有效工具。
• 模型构建：为各种类型的生物数据量身定制的预建模型和可定制架构。
• 可视化：用于解释模型预测和见解的高级可视化工具。
• 集成：与流行的生物信息学工具和框架的无缝集成。
• API：提供Rust和Python API，以方便与不同的深度学习框架集成，确保跨平台的效率操作。

谁应该参与？

我们邀请对生物信息学、深度学习和开源软件开发充满热情的个人和团队参与。无论你是研究人员、开发者还是学生，你的贡献都有助于塑造生物数据分析的未来。

如何参与

• 开发者：贡献代码，修复错误，开发新功能。
• 研究人员：分享你的领域专业知识，帮助验证模型。
• 学生：通过解决现实世界的数据科学问题来获得经验。
• 社区成员：提供反馈，报告问题，帮助扩大用户社区。

加入我们

如果你有兴趣参与，请访问我们的GitHub仓库Github，探索项目并开始。

联系我们

有关更多信息或问题，请随时通过[[email protected]]联系我们。我们期待着你的参与和对此激动人心的项目的贡献！

让我们一起利用深度学习的力量，共同推进生物数据分析领域的发展！