#data #flexible #memory #structure #genomics #mutability #ideal

anndata-memory

使用Rust编写的线程安全的AnnData-like结构,适用于单细胞基因组数据。提供受控的可变性、高效的内存管理和灵活的数据操作。非常适合并发生物信息学应用。

2个发布版本

0.1.0-alpha.1 2024年8月13日
0.1.0-alpha.02024年8月9日

#140 in 生物学

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93 每月下载量
用于 single_rust

BSD-3-Clause

50KB
1K SLoC

🚀 AnnData-Memory:anndata-rs的高性能伴侣 📊

⚠️ 警告

这个库目前处于alpha测试阶段,我们只有有限的时间来测试实现,但我们将在未来实现测试!

🌟 概述

AnnData-Memory是一个高性能的辅助库,旨在补充anndata-rscrate。它专注于提升性能并使AnnData数据集的并行处理更有效。

🔑 主要功能

  • 🏎️ 性能驱动:优化速度和效率
  • 🧵 多核处理:利用并行计算能力
  • 💾 临时AnnData数据集:处理临时数据结构
  • 🔄 H5兼容性
    • 📥 从H5支持的集合创建
    • 📤 转换为H5格式

🎯 主要目标

  1. 通过快速操作增强anndata-rs
  2. 实现无缝的多线程数据处理
  3. 提供灵活的临时数据集处理

🛠️ 使用方法

待办事项

🤝 贡献

待办事项

📜 许可证

待办事项

🙏 致谢

  • 感谢anndata-rs团队所做的出色工作

依赖项

~57MB
~1M SLoC