2 个不稳定版本
0.2.0 | 2022 年 10 月 11 日 |
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0.1.0 | 2022 年 10 月 10 日 |
#22 in #explorer
20KB
306 行
rge
参考基因组浏览器命令行工具。
请求功能 · 报告错误 · ⭐ 考虑星标仓库!⭐
🎨 特性
- 伪自动染色体区域检测。 检测参考基因组中是否存在 X 和 Y 染色体的伪自动染色体区域 (PAR),如果存在,则提供 PAR 的坐标。
📚 入门
安装
要安装最新发布的版本,您可以使用 cargo
。
cargo install rge
要安装 main
上的最新版本,可以使用以下命令。
cargo install --locked --git https://github.com/claymcleod/rge.git
🖥️ 开发
要启动开发环境,请使用以下命令。
# Clone the repository
git clone [email protected]:claymcleod/rge.git
cd rge
# Run the command line tool using cargo.
cargo run -- -h
🚧️ 测试
# Run the project's tests.
cargo test
# Ensure the project doesn't have any linting warnirge.
cargo clippy
# Ensure the project passes `cargo fmt`.
cargo fmt --check
最低支持 Rust 版本 (MSRV)
本项目最低支持的 Rust 版本是 1.64.0。
🤝 贡献
欢迎贡献、问题和功能请求!请随时查看 问题页面。
📝 许可证
版权所有 © 2021-至今 Clay McLeod。本项目可按您的选择获得 MIT 或 Apache 2.0 许可。
依赖项
~5MB
~82K SLoC