2 个不稳定版本

0.2.0 2022 年 10 月 11 日
0.1.0 2022 年 10 月 10 日

#22 in #explorer

MIT/Apache

20KB
306

rge

CI: Status crates.io version crates.io downloads License: MIT License: MIT

参考基因组浏览器命令行工具。

请求功能 · 报告错误 · ⭐ 考虑星标仓库!⭐

🎨 特性

  • 伪自动染色体区域检测。 检测参考基因组中是否存在 X 和 Y 染色体的伪自动染色体区域 (PAR),如果存在,则提供 PAR 的坐标。

📚 入门

安装

要安装最新发布的版本,您可以使用 cargo

cargo install rge

要安装 main 上的最新版本,可以使用以下命令。

cargo install --locked --git https://github.com/claymcleod/rge.git

🖥️ 开发

要启动开发环境,请使用以下命令。

# Clone the repository
git clone [email protected]:claymcleod/rge.git
cd rge

# Run the command line tool using cargo.
cargo run -- -h

🚧️ 测试

# Run the project's tests.
cargo test

# Ensure the project doesn't have any linting warnirge.
cargo clippy

# Ensure the project passes `cargo fmt`.
cargo fmt --check

最低支持 Rust 版本 (MSRV)

本项目最低支持的 Rust 版本是 1.64.0。

🤝 贡献

欢迎贡献、问题和功能请求!请随时查看 问题页面

📝 许可证

版权所有 © 2021-至今 Clay McLeod。本项目可按您的选择获得 MITApache 2.0 许可。

依赖项

~5MB
~82K SLoC