#mutation #genetic #statistical-model

mutexpect

用于确定遗传序列中潜在点突变及其统计概率的实用函数

5 个版本

0.2.7 2021年10月3日
0.2.5 2021年2月17日
0.2.4 2021年2月5日
0.2.3 2020年12月15日
0.2.0 2020年8月5日

#6 in #genetics

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用于 genovo

MITLGPL-3.0

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1.5K SLoC

点突变概率实用库

这个库主要针对我的个人用途。我在 crates.io 上发布它,以便在我的项目中将其作为依赖项。代码已经相当成熟。但确实需要更多的文档注释。

此库读取转录本的基因组序列,并将该转录本中的每个核苷酸进行突变,以确定可以生成多少种类型的突变(同义突变、错义突变、无义突变等)以及它们的概率。当你尝试通过比较受影响个体中的突变基因来识别疾病基因时,这非常有用,并且你需要确定可以通过随机性预期多少突变。

依赖项

~0.5–1.2MB
~26K SLoC