1个不稳定版本
0.1.0 | 2024年5月20日 |
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#209 in 生物学
17KB
349 行
molcv
本仓库包含一个用于计算蛋白质残基圆形方差的Python包和Rust crate。
以下是2H1L结构的示例输出,其中红色对应圆形方差为1,深蓝色对应0。
Rust crate使用WebGPU在GPU上执行计算,同时支持所有主要平台。Python包包含对Rust crate的绑定。
用法
安装
$ cargo add molcv
# Or
$ pip install molcv
用法
# CLI
$ molcv input.pdb --pdb-output-path output.pdb --cutoff 100
$ molcv input.pdb --npy-output-path output.npy --cutoff 50 --cutoff 100
依赖项
~11–43MB
~688K SLoC