#方差 #圆形 #蛋白质 #Python #计算 #Python 包 #残基

bin+lib molcv

计算蛋白质残基的圆形方差的crate

1个不稳定版本

0.1.0 2024年5月20日

#209 in 生物学

EUPL-1.2

17KB
349

molcv

本仓库包含一个用于计算蛋白质残基圆形方差的Python包和Rust crate。

以下是2H1L结构的示例输出,其中红色对应圆形方差为1,深蓝色对应0。

Rust crate使用WebGPU在GPU上执行计算,同时支持所有主要平台。Python包包含对Rust crate的绑定。

用法

安装

$ cargo add molcv
# Or
$ pip install molcv

用法

# CLI
$ molcv input.pdb --pdb-output-path output.pdb --cutoff 100
$ molcv input.pdb --npy-output-path output.npy --cutoff 50 --cutoff 100

依赖项

~11–43MB
~688K SLoC