Heme：用 Rust 编写的分子建模库

Heme 是 Rust 语言中基于力场分子建模的实现。这是一个仍在进行中的项目，帮助我学习 Rust。我希望它最终会变得有用，但现在它还不行。（关于基于力场的分子建模的良好实现，请参阅 OpenMM 或 Lumol 项目。）

特性

Heme 以蛋白质为中心，因此目前

• 解析 PDB 结构
• Pose 对象代表一个蛋白质结构
• Atom 对象代表一个单个原子
• both Pose 和 Atom 都具有用于计算结构特征的方法，例如两个原子之间的距离，或某个原子附近的一些截止值内的残基

计划

• 我打算保持 Heme 是一个简单的库，用于读取 PDB 和处理蛋白质结构，在我继续学习 Rust 的过程中
• 简单的分子建模是可能的，了解实现力场会很有趣
• 我想添加一些功能，如
  • 获取 Pose 对象的序列
  • Residue 对象