#package #distribution #partition #calculations #cumulative #chromosome #genomic-distributions

bin+lib gdrs

A rust implementation of GenomicDistributions package from bioconductor

4 个版本

0.1.3 2024年3月28日
0.1.2 2024年3月28日
0.1.1 2024年3月26日
0.1.0 2024年3月26日

生物学 类别中排名 129

MIT 许可证

14KB
286 代码行

gdrs

gdrs 是 bioconductor 的 GenomicDistributions 包的 Rust 实现。

路线图

理想情况下,我们希望实现原始包的所有功能。然而,我们是从基本功能开始的,并将随着进程的进行添加更多功能。目前没有计划实现原始包的绘图功能,只实现数据生成功能

  • 染色体分布
  • 邻接距离
  • GC 含量
  • 分区计算
  • 累积分区计算
  • 到 TSS 的距离
  • 二核苷酸频率

安装

cargo add gdrs

依赖项

~17–27MB
~380K SLoC