#蛋白质组学 #算法 #数据 #人口学 #质谱学 #生物信息学 #解析器

人口学蛋白质组学

Rust库,用于处理由Census算法量化的蛋白质组学数据

12个版本

0.3.3 2021年1月18日
0.3.2 2021年1月18日
0.3.1 2020年9月20日
0.3.0 2020年8月5日
0.1.4 2019年5月13日

#193 in 生物学

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census

一个高性能的Rust库,用于解析、过滤和处理使用Census算法量化的多路复用等量蛋白质组学数据。

我们的工作使用Census算法(作为IP2的一部分)来量化来自复杂样品的TMT(串联质量标签)蛋白质组学数据。快速、

Census算法引用

Census 2: 等量标记数据分析,生物信息学,2014年3月28日

一种基于质谱的蛋白质组学定量分析软件工具。Sung Kyu Park,John D Venable,Tao Xu,John R Yates III,自然方法,2008年,5,319-322


lib.rs:

一个高性能的Rust库,用于解析、过滤和处理使用Census算法量化的多路复用等量数据

依赖项

~2.2–3.5MB
~57K SLoC