4 个版本 (2 个重大更改)
0.3.1 | 2024年6月20日 |
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0.3.0 | 2024年4月25日 |
0.2.0 | 2024年1月16日 |
0.1.1 | 2024年1月11日 |
0.1.0 |
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#53 在 生物学
每月下载量 47
1.5MB
1.5K SLoC
WebGestalt Rust
Rust 实现 WebGestaltR.
备注
此 CLI 专注于计算。 它不提供 GMT 文件或 HTML 报告。该工具的输出是包含结果的 JSON 文件。要获取功能更完整的工具,请参阅原始的 WebGestaltR 工具。
安装
需要 rust 工具链。然后在您的终端中运行以下命令
cargo install webgestalt
CLI
有关 CLI 的帮助,请运行
webgestalt --help
使用 kegg.gmt
运行过代表性分析示例,有趣的列表在 int.txt
,参考为 ref.txt
。输出 output.json
JSON 文件
webgestalt ora -g kegg.gmt -i int.txt -r ref.txt -o output.json
依赖项
~10–19MB
~256K SLoC