nwbview

nwbview 是一个用于显示二进制 NWB 文件格式内容的软件。它用 Rust 编写，以实现高性能、内存安全和易于部署。

NWB 格式

神经数据无国界 (NWB) 是一种标准数据格式，用于表示神经生理学数据文件。它使得不同神经科学实验室产生的神经生理学数据可以互操作。存储在 .NWB 格式中的数据范围从膜片钳实验到光学生理学实验。

NWB 格式使用的底层存储技术是二进制 HDF 格式。虽然将文件作为二进制存储在读写速度和文件大小方面具有优势，但它以人类无法读取的方式存储数据。即无法在文本编辑器中打开文件以查看内容，因此需要查看器。

GUI

下面的截图显示了 nwbview 的 GUI。左侧面板以树状结构显示 NWB 文件的内容。右侧面板显示所选项目的详细信息，可以是图表、表格或文本。

nwbview 使用 egui Rust GUI 库进行渲染。

公共 NWB 数据源

以下是一些可以用 nwbview 显示的公共 NWB 数据源。

• nwb.org/example-datasets
• channelpedia

使用 cargo 安装和运行

首先安装 cargo 软件包管理器，然后运行以下命令安装 nwbview。

cargo install nwbview

安装完成后，只需在控制台中输入 nwbview 即可运行。

nwbview

从源代码构建和运行

Rust 库依赖关系在 cargo.toml 文件中提供。

请注意，Rust库依赖于以下系统包，需要提供这些包。

• libgtk-3-dev
• librust-atk-dev
• libhdf5-serial-dev

不同系统的包名可能有所不同。

一旦所有依赖项都满足后，进入包含 cargo.toml 的目录，并运行以下命令。

cargo run --release

发布标志会构建具有优化的工件。在需要调试时不要指定它。

如何贡献

所有贡献都受到欢迎并非常感激 :)

nwbview 目前处于 alpha 版本。不要犹豫，创建一个带有您建议的新问题。

我们使用 Github 的问题跟踪器、拉取请求和讨论界面进行贡献。

拉取请求需要维护者的批准以及 CI 检查。