Lib.rs

nons 是一个简单且希望不会太慢的程序，通过取这些 contigs 对齐读取的共识来填充 Ns。

要运行它，取您的排序 BAM 文件（可能由 BamM 创建）并运行 nons

nons contigs_with_Ns.fna reads_aligned_to_contigs_with_Ns.bam >filled_contigs.fna

filled_contigs.fna 现在应该不包含任何 N，除非那些位置没有 Ns 对齐。

安装

安装 rust 后，通过 cargo 安装 nons

cargo install nons

帮助

最简单的方法可能是通过 GitHub 提交问题 或直接联系作者 联系。

许可证

nons 由 Ben Woodcroft (@wwood) 在 澳大利亚生态基因组中心（昆士兰大学） 编写，并许可在 GPL3 或更高版本 下。许可证副本包含在存储库中。